Liaisons peptidiques : définition, occurrence et importance biologique

Le liaison peptidique est une liaison amide covalente reliant des résidus d'acides aminés dans les peptides et les protéines. Ces liaisons forment le squelette moléculaire continu des chaînes peptidiques, préservant un ordre spécifique d'acides aminés tout en permettant à l'ensemble de la chaîne d'adopter différentes structures tridimensionnelles.

Les liaisons peptidiques sont l'un des éléments fondamentaux de la structure des peptides. La compréhension de leur chimie aide à expliquer comment des acides aminés individuels peuvent former des molécules plus grandes dotées d'une séquence et d'une structure bien définies.

Bien que la définition de base soit relativement simple, la chimie de la liaison peptidique présente plusieurs caractéristiques importantes. Les électrons au sein du groupe amide sont disposés de telle sorte que la liaison carbone-azote ressemble partiellement à une double liaison. Cela limite la possibilité de rotation libre autour de la liaison peptidique, mais ne rend pas l'ensemble du peptide ou de la protéine rigide. D'autres liaisons du squelette conservent une plus grande liberté de rotation, ce qui permet aux chaînes peptidiques de se plier et de se replier.

Les liaisons peptidiques peuvent être analysées sous plusieurs perspectives scientifiques différentes. Les chimistes étudient leur structure électronique et leur géométrie. Les biologiste moléculaires analysent la manière dont elles sont formées par les ribosomes et d'autres systèmes biologiques. Les biologistes structuraux examinent comment la géométrie de ces liaisons influence l'architecture des protéines. Les biochimistes, quant à eux, étudient la manière dont les enzymes rompent sélectivement les liaisons peptidiques lors du traitement et de la dégradation des protéines.

Ces distinctions aident à comprendre comment les protéines peuvent simultanément conserver une séquence d'acides aminés spécifique, adopter des structures complexes, être synthétisées dans le cadre de processus biologiques contrôlés, puis subir une transformation ou une dégradation. L'étude de la structure électronique, de la géométrie des peptides, de la catalyse ribosomique, de la synthèse des protéines et de l'hydrolyse enzymatique fournit des informations complémentaires sur ces processus. [1] [2] [3]

Qu'est-ce qu'une liaison peptidique ?

Définition chimique de la liaison peptidique

La liaison peptidique est liaison amide entre le groupe dérivé du groupe carboxyle d'un acide aminé et le groupe dérivé du groupe amine d'un autre acide aminé. Dans un squelette protéique typique, l'atome de carbone du groupe carbonyle et l'atome d'azote du résidu d'acide aminé suivant sont liés.

Le fragment le plus fréquemment représenté a la forme de :

–C(=O)–NH–

Le fragment C=O est groupe carbonyle, tandis que la liaison C–N est celle à laquelle nous pensons généralement lorsque nous parlons spécifiquement de la liaison peptidique. Ensemble, ces atomes et leur environnement immédiat forment ce qu'on appelle groupe peptidique ou groupe amide.

Cette distinction est importante car la formule développée complète du groupe peptidique contient plusieurs liaisons différentes. La liaison carbone-oxygène n'est pas la connexion reliant deux résidus d'acides aminés entre eux. Cette fonction est assurée par la liaison amide carbone-azote.

Lorsqu'un acide aminé est lié à un autre, l'atome de carbone du groupe carbonyle lié à un résidu est lié de manière covalente à l'atome d'azote lié au résidu suivant. La répétition de ce schéma conduit à la formation du squelette d'une chaîne peptidique typique.

Les études de structure électronique analysent entre autres l'interaction du doublet libre de l'azote avec le système carbonyle voisin, ce qui permet d'expliquer pourquoi cette liaison diffère d'une liaison simple carbone-azote ordinaire à rotation libre. [1]

Pourquoi la liaison peptidique est-elle une liaison covalente ?

La liaison peptidique est covalent, car les atomes liés partagent des électrons.

Il ne s'agit ni d'une interaction ionique entre deux acides aminés chargés distincts, ni d'une liaison hydrogène maintenant à proximité différentes parties d'une chaîne repliée.

C'est précisément cette liaison covalente qui assure la continuité chimique de la séquence en acides aminés. Les résidus restent partie intégrante de la même chaîne jusqu'à ce qu'une réaction chimique modifie leur mode de liaison.

Cette distinction devient particulièrement importante lors de la discussion du repliement et du dépliement des protéines. La chaîne peptidique peut se plier, changer de conformation, perdre une partie des interactions stabilisant sa structure, et même subir un dépliement significatif sans qu'il soit nécessaire de rompre les liaisons peptidiques maintenant sa séquence primaire.

Cependant, covalent ne signifie pas indestructible.

Les enzymes et des conditions chimiques appropriées peuvent provoquer le clivage des liaisons peptidiques. Un tel clivage est cependant une réaction chimique modifiant la façon dont les atomes sont liés, et non seulement par un changement de forme de la molécule.

Des études structurales de l'une des protéinases aspartiques montrent comment l'enzyme peut organiser de manière adéquate le substrat contenant une liaison peptidique et une molécule d'eau d'une manière essentielle pour l'hydrolyse. [4]

Caractère partiel de la double liaison et résonance

La liaison peptidique C–N est souvent représentée sur les formules par une simple ligne, mais la distribution réelle des électrons est plus complexe.

La paire d'électrons libre de l'atome d'azote peut participer au système électronique voisin du groupe carbonyle. La délocalisation des électrons confère à la liaison C–N caractère partiel de la double liaison.

Ce phénomène s'explique souvent à l'aide de structures de résonance.

Les structures de résonance sont des manières alternatives de représenter la distribution des électrons dans une même molécule. Elles ne doivent pas être interprétées comme des formes distinctes de la molécule qui se convertissent rapidement l'une en l'autre.

De même, le caractère partiellement double de la liaison ne signifie pas que la liaison peptidique est une liaison simple ordinaire pendant un certain pourcentage du temps et une liaison double ordinaire le reste du temps.

La structure électronique réelle résulte de la délocalisation des électrons au sein de tout le groupe amide.

Dans une étude informatique, Fedorov a analysé la contribution de la résonance à la détermination de l'ordre de la liaison peptidique. Les valeurs numériques détaillées dépendent de la méthode d'analyse de la structure électronique utilisée. Pour une compréhension générale, la conclusion la plus importante est cependant que l'interaction entre le système électronique de l'azote et celui du groupe carbonyle est responsable d'une partie des propriétés inhabituelles de la liaison C–N. [1]

Pourquoi la rotation autour de la liaison peptidique est-elle limitée ?

Le caractère partiel de la double liaison a une conséquence structurale importante : la rotation autour de la liaison C–N amide est plus limitée que la rotation autour d'une liaison simple carbone–azote typique.

Cela ne signifie pas pour autant que les protéines ne peuvent ni se plier ni se replier.

Le squelette peptidique contient également d'autres liaisons autour desquelles une rotation est possible. La chaîne protéique est donc constituée de groupes peptidiques répétitifs, relativement rigides, reliés par d'autres liaisons du squelette caractérisées par une plus grande flexibilité conformationnelle.

La combinaison de ces contraintes et de ces possibilités de rotation contribue à l'énorme diversité des structures tridimensionnelles que peuvent adopter les peptides et les protéines.

La platitude approximative n'implique pas une structure parfaitement plate

La délocalisation des électrons favorise dans l'approximation de la géométrie plane du groupe peptidique et restreint la rotation autour de la liaison amide C–N.

Cependant, les structures moléculaires réelles peuvent s'écarter légèrement de la planéité mathématique idéale.

Improta et ses collaborateurs ont combiné des calculs de mécanique quantique avec l'analyse des structures cristallines de peptides et de protéines. Les résultats ont révélé de légers écarts systématiques dépendants de la géométrie locale du squelette. [2]

Il est donc exact d'affirmer que les groupes peptidiques sont à peu près plat, cependant, affirmer que chaque liaison peptidique dans chaque peptide ou protéine est parfaitement plane serait une simplification excessive.

C'est un bon exemple de la différence entre un modèle éducatif utile et le comportement plus détaillé des structures moléculaires réelles.

Où trouve-t-on les liaisons peptidiques ?

Dans le squelette des peptides et des protéines

Les liaisons peptidiques se trouvent entre les résidus d'acides aminés adjacents dans les chaînes peptidiques et protéiques typiques.

Avec les atomes qui les entourent, ils forment un répété squelette moléculaire. Les chaînes latérales des acides aminés dépassent de ce squelette et confèrent des propriétés chimiques supplémentaires à chaque résidu.

Une protéine peut être composée d'une seule chaîne peptidique ou de plusieurs chaînes reliées en un complexe moléculaire plus vaste. Chacune d'elles possède ses propres liaisons du squelette.

Diverses chaînes peuvent se lier par des interactions non covalentes ou des liaisons covalentes supplémentaires. De telles liaisons ne doivent pas être automatiquement assimilées à des liaisons peptidiques.

La synthèse chimique de l'inhibiteur trypsique pancréatique bovin, ou BPTI, illustre bien la différence entre la formation du squelette peptidique et l'établissement des ponts disulfure supplémentaires. Les chercheurs ont d'abord obtenu le matériel linéaire, puis ont procédé à son oxydation et à sa caractérisation. L'étude sépare donc la construction de la chaîne de son organisation structurelle ultérieure. [5]

Les liaisons peptidiques déterminent la continuité de la séquence primaire

séquence des résidus d'acides aminés dans un peptide ou une protéine structure primaire.

Les liaisons peptidiques assurent la continuité covalente fondamentale qui maintient cette séquence.

Par exemple, la séquence :

Ala–Gly–Ser

contient les trois mêmes types d'acides aminés que :

Ser–Gly–Ala

Ce ne sont cependant pas les mêmes séquences peptidiques.

La position des différents résidus par rapport aux liaisons peptidiques est différente.

C'est pourquoi la seule liste des aminoacides présents dans l'échantillon ne suffit pas à identifier le peptide. Il est également nécessaire de connaître leur ordre et leur mode de liaison.

Dans les peptides linéaires et cycliques

Une chaîne peptidique ouverte typique a deux extrémités, appelées À la fin i C-koniec.

Le N-terminal correspond à une extrémité du squelette peptidique et le C-terminal à l'autre. Les séquences peptidiques sont classiquement écrites de l'extrémité N-terminale vers l'extrémité C-terminale.

Peptide cyclique de tête à queue, c'est-à-dire fermé par la liaison des extrémités de la chaîne, contient une liaison squelettique supplémentaire formant un cycle.

Cependant, tous les peptides cycliques ne se referment pas de la même manière. Le cycle peut également se former avec la participation d'une chaîne latérale, et certaines molécules contiennent plus d'un type de liaison croisée.

Terme cyclique elle décrit donc une caractéristique de l'architecture de la molécule, et non un seul mode universel de liaison.

La kalata B1 est un exemple concret de peptide dont le squelette cyclique a été confirmé, entre autres, par des études de clivage enzymatique, une analyse de séquence et la structure moléculaire. La molécule contient également des ponts disulfure. Ces liaisons soufre-soufre supplémentaires diffèrent chimiquement des liaisons amides reliant les résidus du squelette peptidique. [6]

Liaisons peptidiques et liaisons isopeptidiques

Dans un squelette protéique typique, les liaisons peptidiques relient les groupes aminés principaux et les groupes issus des groupes carboxyles.

Liaison amide, dans la formation de laquelle participe groupe fonctionnel de la chaîne latérale d'un acide aminé, est souvent décrit comme liaison isopeptidique.

La règle la plus importante est donc d'établir quels atomes ont réellement été liés entre eux.

La seule présence d'une liaison amide n'implique pas automatiquement qu'elle se trouve dans un squelette peptidique typique. En même temps, toute liaison transversale dans un peptide ou une protéine n'est pas une liaison amide — les ponts disulfures et autres modifications covalentes ont une chimie différente.

Pour les débutants, le point de départ le plus utile est constitué par les liaisons peptidiques ordinaires présentes dans le squelette. Les liaisons plus spécialisées peuvent ensuite être considérées comme des variantes distinctes de l'organisation moléculaire.

Combien de liaisons peptidiques y a-t-il dans la chaîne ?

Chaîne simple ouverte et non ramifiée contenant Un peptide de n résidus d'acides aminés possède n − 1 liaisons peptidiques dans son squelette..

Cela signifie que :

• un dipeptide a 2 résidus et 1 liaison peptidique ;
• le tripeptide a 3 résidus et 2 liaisons peptidiques ;
• le tétrapeptide a 4 résidus et 3 liaisons peptidiques ;
• Un pentapeptide a 5 résidus et 4 liaisons peptidiques ;
• une chaîne ouverte contenant 10 résidus possède 9 liaisons peptidiques.

Cette dépendance résulte directement du mode de liaison de la molécule : chaque résidu supplémentaire allonge la chaîne existante par une liaison squelettique supplémentaire.

Correspondant chaîne cyclique de type tête-bêche contient n liaisons peptidiques dans le squelette, car une liaison supplémentaire ferme le cycle.

Ces hypothèses restent néanmoins importantes. Les ramifications, les liaisons atypiques de chaînes latérales, la présence de plusieurs chaînes, les liaisons isopeptidiques ou des éléments de squelette autres que des liaisons amides nécessitent une analyse plus détaillée.

Le seul nombre de résidus ne suffit donc pas toujours pour déterminer toutes les liaisons covalentes présentes dans un peptide complexe ou une protéine.

Comment les liaisons peptidiques unissent-elles les acides aminés ?

Des acides aminés libres aux résidus d'acides aminés

Un acide aminé libre et le résidu correspondant présent dans un peptide sont liés, mais ne décrivent pas exactement le même état chimique.

Lorsqu'un acide aminé est incorporé dans un peptide, ses groupes fonctionnels participent aux liaisons formant la chaîne.

Par exemple, la combinaison de la glycine et de l'alanine dans un certain ordre conduit à la formation de glycylalanine. L'inversion de l'ordre conduit à la création alanylglycine.

Les types d'acides aminés sont les mêmes, mais leur position et leur environnement chimique diffèrent.

Cela montre pourquoi la séquence d'un peptide contient plus d'informations qu'une simple liste de ses composants.

La formation de liaisons peut être étudiée directement. Stachelhaus et ses collaborateurs ont analysé des éléments du système de synthèse des peptides non ribosomiques et ont démontré qu'une modification du résidu situé dans le site catalytique proposé empêchait la réaction de condensation étudiée. L'expérience associe donc la formation d'un produit peptidique spécifique à l'action d'une machinerie moléculaire concrète. [7]

L'équation de condensation est un modèle de bilan de réaction

En chimie de base, la formation d'un peptide est souvent représentée par l'équation :

acide aminé + acide aminé → dipeptide + eau

L'équation montre la différence de composition entre les molécules de départ libres et le produit combiné.

Il est utile pour comprendre la relation chimique entre les réactifs et le produit.

Cependant, il ne doit pas être interprété comme un mécanisme complet de synthèse protéique au sein d'une cellule vivante.

Les acides aminés libres ne se contentent pas de s'aligner les uns à côté des autres dans l'eau, de libérer spontanément des molécules d'eau et de former d'eux-mêmes une séquence protéique déterminée.

La synthèse biologique nécessite des substrats activés, une machinerie moléculaire ordonnée, des informations définissant la séquence et des processus préparatoires nécessitant de l'énergie.

Il est donc essentiel de faire la distinction entre par une équation chimique globale a le mécanisme de la réaction.

L'équation décrit la composition initiale et finale. Le mécanisme explique les étapes moléculaires réelles et les intermédiaires menant à la réaction.

Des expériences sur les ribosomes étudient précisément de tels détails mécanistiques, plutôt que de se contenter de reproduire l'équation de condensation connue. [3]

Comment le ribosome forme-t-il des liaisons peptidiques ?

Lors de la traduction, les acides ribonucléiques de transfert, ou ARNt, transportent les acides aminés et la chaîne peptidique en croissance au sein du ribosome.

Le groupe amine du nouvel acide aminé nouvellement fourni réagit avec l'extrémité activée de la chaîne existante liée à l'ARNt, ce résidu conduisant au transfert du peptide en croissance vers le résidu lié au nouvel ARNt.

Le chaîne peptidique est généralement allongée à partir de l'extrémité Fin-août.

L'activation des acides aminés et leur fixation au ARNt sont des processus dépendants de l'énergie. Par conséquent, la description de toute liaison peptidique ribosomique comme se formant directement entre deux acides aminés libres ou comme une simple „ élimination d'eau ” par le ribosome constituerait une simplification excessive.

Weinger et collaborateurs ont modifié un groupe chimique dans le substrat d'ARNt et ont observé une limitation significative de la formation de liaisons peptidiques sans diminution correspondante de la liaison du substrat. Ce résultat a fourni des preuves que catalyse assistée par le substrat, dans laquelle les propriétés chimiques des substrats eux-mêmes participent au déroulement de la réaction. [3]

L'expérience indique donc le rôle mécanistique de la chimie de l'ARNt, et non exclusivement sa fonction de transporteur passif.

La formation des liaisons peptidiques a une orientation spécifique

La synthèse des protéines est un processus directionnel.

Puisque la chaîne croissante est allongée à partir de l'extrémité C-terminale, la séquence se développe dans une orientation spécifique.

Ceci est lié à la convention courante d'écriture des séquences de peptides et de protéines à partir de De N-terმიne à C-terმიne.

Cependant, la direction n'est pas seulement une convention d'écriture. L'inversion de la séquence conduit généralement à la formation d'une autre molécule, car chaque résidu occupe alors une position différente par rapport aux autres éléments de la chaîne.

D'autres moyens de créer un type de liaison similaire

Les liaisons peptidiques peuvent également se former en dehors du ribosome.

Spécialisées systèmes enzymatiques non ribosomiques synthétisent certains peptides, tandis que la synthèse peptidique en laboratoire utilise des composants activés et des réactions de couplage contrôlées.

Ces voies diffèrent par leur organisation, leurs substrats, leurs conditions de réaction et leurs mécanismes catalytiques.

Il ne faut pas les considérer comme des processus identiques simplement parce que les produits finaux contiennent des liaisons amides.

L'étude de la formation de liaisons non ribosomiques et la synthèse chimique de l'IBP constituent des exemples de ces modes de production distincts. [7] [5]

Le mode de production en soi ne détermine pas non plus si une molécule donnée est un peptide ou une protéine. La synthèse chimique peut conduire à l'obtention d'un matériel correspondant à un peptide ou à une protéine d'origine naturelle, à condition d'établir correctement sa séquence et d'autres caractéristiques structurales essentielles.

Liaisons peptidiques et autres liaisons dans les protéines

Liaisons du squelette et interactions responsables du repliement

Les liaisons peptidiques maintiennent la séquence d'acides aminés liée.

D'autres interactions aident en revanche à déterminer la manière dont cette séquence se dispose dans l'espace tridimensionnel ou dont les différentes chaînes peptidiques interagissent entre elles.

Les liaisons hydrogène se forment entre des donneurs et des accepteurs d'hydrogène appropriés. Au sein du squelette peptidique, les atomes d'oxygène des groupes carbonyle peuvent agir comme accepteurs, et de nombreux groupes amide N–H peuvent servir de donneurs.

L'azote amide n'est généralement pas considéré comme un accepteur de liaison hydrogène, car sa paire d'électrons libre participe au système électronique du groupe amide.

Les groupes peptidiques contenant de la proline requièrent également une attention particulière, car l'azote du squelette ne possède alors pas l'hydrogène N–H typique.

Le groupe contenant la liaison peptidique peut donc participer à la formation de liaisons hydrogène, mais la liaison peptidique et la liaison hydrogène sont des types de liaisons différents.

L'un d'eux lie de manière covalente les résidus d'acides aminés. L'autre participe à des interactions intrand ou intermoléculaires.

Des recherches sur le court peptide plissé CLN025 ont analysé la structure stabilisée, entre autres, par des liaisons hydrogène et d'autres interactions intramoléculaires. Cela montre que le repliement peut se produire sans la création d'une nouvelle séquence de squelette. [8]

Les ponts disulfure relient les chaînes latérales contenant du soufre

Les ponts disulfures sont des liaisons covalentes soufre-soufre qui se forment le plus souvent entre les chaînes latérales de la cystéine.

Ils peuvent relier des fragments distants de la même chaîne peptidique ou différentes chaînes.

Ce ne sont pas des liaisons peptidiques et elles ne sont pas présentes dans toutes les protéines.

La formation ou la rupture d'un pont disulfure peut modifier significativement l'organisation spatiale de la molécule sans qu'il soit nécessaire de couper son squelette peptidique.

Dans le cadre d'une étude sur la synthèse du BPTI, une séquence naturelle et des analogues conçus pour modifier la capacité de formation de ponts disulfures ont été préparés. Le matériel de séquence naturelle a été comparé au BPTI naturel à l'aide de méthodes analytiques et fonctionnelles. Le résumé de la publication ne confirmait pas toutes les conséquences structurelles concernant les analogues, par conséquent les différences proposées ne doivent pas être présentées comme des résultats pleinement établis. [5]

Interactions ioniques et hydrophobes

Les groupes chargés peuvent s'attirer ou se repousser, influençant l'organisation spatiale de la molécule.

En revanche, les régions non polaires interagissent avec le milieu aqueux d'une manière qui peut favoriser leur enfouissement au cœur de la structure, leur association ou leur agrégation. Ce phénomène est souvent évoqué dans le contexte de l'effet hydrophobe.

Ces interactions peuvent avoir une importance capitale pour le repliement des protéines, mais l'interaction hydrophobe n'est pas une nouvelle liaison covalente entre les acides aminés.

C'est pourquoi il est incorrect de qualifier toutes les forces stabilisant les protéines de liaisons peptidiques.

Les différents types d'interactions peuvent également réagir différemment à la température, au solvant, à l'acidité, aux conditions ioniques et à d'autres changements environnementaux. Déterminer quel type de liaison ou d'interaction est altéré permet de mieux comprendre le résultat de l'expérience.

La dénaturation n'est pas la même chose que l'hydrolyse

Dénaturation modifie l'organisation structurelle typique de la protéine.

Il peut perturber le repliement ou l'association des molécules tout en laissant la plupart ou la totalité des liaisons peptidiques intactes.

Hydrolyse modifie en revanche les liaisons chimiques en clivant une liaison sensible lors d'une réaction impliquant de l'eau.

Dans certaines conditions, les deux processus peuvent se produire dans le même échantillon, mais ils ne sont pas synonymes.

Le dépliage d'une protéine ne signifie donc pas automatiquement sa transformation en peptides plus courts ou en acides aminés libres.

Cette distinction est également visible dans les études structurelles. Dans les expériences concernant le collagène thermiquement déroulé, différentes configurations cis et trans des liaisons peptidiques associées à la proline ont été identifiées. Le changement de configuration du squelette est un phénomène différent de son clivage chimique. [9]

Formation, propriétés et hydrolyse des liaisons peptidiques

La stabilité dépend du type de réaction analysée

Les liaisons peptidiques sont suffisamment stables pour maintenir les chaînes biologiques, tout en permettant aux organismes de les former et de les rompre de manière sélective.

Il n'y a pas de contradiction là-dedans.

La vitesse de réaction dépend entre autres de les barrières d'activation et la présence de catalyseurs, tandis que la question de savoir si une réaction donnée est thermodynamiquement favorable relève d'une autre problématique.

Le processus peut être chimiquement possible, mais sans une catalyse appropriée, il se déroulerait extrêmement lentement.

D'autre part, un enzyme peut accélérer considérablement une réaction spécifique en fournissant une voie réactionnelle plus favorable.

L'enzyme ne convertit pas la liaison peptidique en un tout autre type de liaison. Elle modifie la voie par laquelle se déroule la réaction chimique.

Il serait également erroné d'attribuer une durée de vie universelle unique à toutes les liaisons peptidiques, à tous les peptides ou à toutes les protéines présents dans l'eau.

La séquence, la structure locale, l'accessibilité de la liaison, les groupements chimiques voisins, la température, le pH, la composition de la solution et la présence de catalyseurs peuvent influencer le comportement observé.

Que modifie l'hydrolyse ?

L'hydrolyse utilise l'eau dans une réaction de clivage chimique de la liaison amide, ce qui conduit à la formation de nouveaux groupes terminaux dérivés des groupes carboxyle et amino.

Leur forme ionique exacte dépend des conditions de la solution environnante.

La coupure d'une seule liaison dans le squelette ne conduit pas automatiquement à la formation d'acides aminés libres.

Si une liaison peptidique interne est rompue dans une longue chaîne ouverte, les produits directs seront généralement deux fragments peptidiques plus courts.

D'autres réactions de clivage sont nécessaires pour raccourcir progressivement ces fragments et libérer finalement des acides aminés individuels.

Des études structurales sur la pénicillopepsine ont analysé la manière dont la protéinase aspartylique peut organiser l'eau et les groupes du substrat au cours du processus d'hydrolyse. Le modèle de réaction proposé s'appuie sur des observations cristallographiques et sur la modélisation. Il fournit des informations sur un mécanisme enzymatique particulier, mais ne prouve pas que toutes les protéases utilisent un mode de catalyse identique. [4]

L'hydrolyse peut être sélective

Les protéases et les peptidases diffèrent par les liaisons qu'elles reconnaissent et leurs environnements moléculaires.

Certains enzymes coupent les liaisons situées à l'intérieur de la chaîne, tandis que d'autres éliminent des résidus de ses extrémités.

La séquence, la structure locale, l'accessibilité et les groupes chimiques environnants peuvent influencer le fait qu'un site potentiellement vulnérable soit effectivement clivé.

Davidson et Hutton ont étudié une enzyme liée aux granules sécréteurs d'insuline. La préparation purifiée éliminait les résidus basiques des substrats dérivés de la proinsuline et, dans le test utilisé, ne provoquait pas de dégradation supplémentaire de l'insuline mature. [10]

Cela montre traitement biologique sélectif, et non pas la rupture aléatoire de toutes les liaisons peptidiques.

Le clivage sélectif revêt une importance biologique majeure, car des molécules précurseurs plus grandes peuvent être traitées à des sites spécifiques, conduisant à la formation de produits matures précis plutôt qu'à une dégradation aléatoire.

Les conditions comptent : deux exemples expérimentaux

Kenley et Warne ont étudié l'interleukine 11 humaine recombinante dans des conditions de stress induit, comprenant une température élevée et différentes valeurs de pH.

Dans un environnement acide, ils ont identifié un clivage au niveau du site spécifique Asp–Pro. Les résultats montrent une dégradation dépendante de la séquence et des conditions, mais ne doivent pas être transformés en une règle universelle décrivant le comportement de toutes les protéines dans des conditions biologiques typiques. [11]

Une autre étude a observé la fragmentation d'un peptide vasoactif intestinal radio-iodé dans une solution diluée à pH neutre. Des fragments apparentés plus courts n'ont pas montré de dégradation mesurable dans les mêmes conditions expérimentales, et des additifs à la solution ont influencé le résultat. [12]

Les deux études montrent pourquoi la stabilité des liaisons peptidiques doit être discutée par rapport à de la molécule spécifique, de la séquence, de l'environnement et des conditions expérimentales, plutôt que de supposer qu'un pH ou une température spécifiques provoqueront le même comportement pour chaque peptide.

Pourquoi les liaisons peptidiques sont-elles biologiquement importantes ?

Les liaisons peptidiques conservent l'ordre des résidus d'acides aminés qui définit la chaîne peptidique ou protéique.

Leur géométrie limite les arrangements spatiaux possibles de la chaîne, tandis que les groupes carbonyle et azotés, présents dans le squelette peptidique, participent aux interactions moléculaires.

La formation contrôlée de liaisons peptidiques permet la synthèse de peptides et de protéines.

Le clivage contrôlé de ces liaisons participe en revanche au traitement des précurseurs, à la digestion, au renouvellement des protéines, aux voies de régulation et à la dégradation finale des molécules.

Le même type fondamental de liaison chimique participe donc à plusieurs niveaux d'organisation biologique.

Son apparition établit la continuité de la séquence.

Sa structure électronique influence la géométrie du squelette.

Les groupes chimiques présents dans celui-ci participent aux interactions moléculaires.

Sa dégradation sélective permet aux systèmes biologiques de transformer et de éliminer les protéines et les peptides.

Ces fonctions associent la chimie moléculaire à la biologie. Les preuves proviennent notamment d’expériences structurantes, de mesures structurelles, d’études enzymatiques, de synthèses chimiques et d’expériences utilisant des systèmes biologiques complets. Chaque méthode révèle un élément différent du mécanisme et ne doit pas être utilisée pour tirer des conclusions allant au-delà du processus réellement étudié. [2] [3] [10]

Questions fréquemment posées

1. L’adhésion peptidique est-elle covalente ?

Oui. Le lien peptidique est un lien amidique covalente entre des groupes issus d’acides aminés. L’atome d’azote et l’atome d’oxygène partagent les électrons, ce qui assure la continuité chimique de la chaîne peptidique. Les études de la structure électronique analysent comment ce partage des électrons affecte le groupe carboxyle voisin et comment il contribue aux propriétés caractéristiques du lien amidique. Cependant, le terme „ covalente ” ne signifie pas que les liaisons ne peuvent pas être décomposées. Dans des conditions chimiques appropriées ou avec l’aide d’enzymes, elles peuvent être hydrolytées. Ce qui importe vraiment, c’est de distinguer que le lien peptidique se lie chimiquement entre les parties d’une seule molécule et ne fait pas que provoquer une attraction entre les différentes molécules ou fragments de la même molécule. [1]

2. Pourquoi le liaison peptidique a un caractère de liaison double partiel ?

Le caractère partiel de la liaison double résulte de l’interaction de la vapeur libre d’électron de l’azote avec le système électronique voisin de la groupement carbonylique. Grâce à cela, la densité électronique est délocalisée au sein de la groupement amidique. Les études informatiques ont analysé la part de ce phénomène dans la chaîne de liaison peptidique. Les structures résonantes utilisées pour expliquer cette liaison sont des moyens alternatifs de représentation de la même structure électronique, et non de molécules distinctes se modifiant l’une par rapport à l’autre. Les valeurs numériques décrivant la chaîne de liaison peuvent également dépendre de la méthode analytique utilisée. La plus importante conséquence structurelle est la restriction du mouvement autour de la liaison C–N par rapport à la liaison simple typique, qui tourne librement. [1]

3. Quels atomes constituent le lien peptidique ?

Dans un peptide typique, le lien peptidique relie l’atome de carbone de la carbamoylée de l’une des deux parties à l’atome d’azote de l’autre partie. L’atome d’oxygène reste dans la carbamoylée et ne constitue pas une liaison directe entre les deux parties d’aminoacide. Les études électroniques et structurelles analysent ces atomes comme un élément d’une groupement amidique lié, tout en distinguant leurs liaisons respectives. Lors de l’identification d’un lien peptidique typique dans un modèle structurel, un point de départ utile est donc de trouver un lien C–N directement adjacent à la carbamoylée. [2]

4. Où se trouve la liaison peptidique dans la protéine?

Les liaisons peptidiques se trouvent dans le schéma de chaque chaîne protéique et relient les restes d’aminoacides voisins. Elles diffèrent des liaisons transversales entre les chaînes latérales et des interactions entre les chaînes séparées. La synthèse chimique des BPTI montre cette distinction en séparant la structure du schéma de la formation ultérieure des ponts disarsiques. La structure tridimensionnelle complète du protéine peut contenir de nombreux types d’interactions covalentes et non covalentes, c’est pourquoi l’identification des liaisons peptidiques nécessite la détection du schéma aminoléique plutôt que le calcul de toutes les liaisons ou connexions représentées sur le modèle moléculaire. [5]

5. Est-ce que chaque liaison amidique est une liaison peptidique ?

Non. Les liaisons amidiques se rencontrent dans de nombreux composés organiques différents, tandis que le terme „ liaison peptidique ” désigne des liaisons spécifiques issues d’acides aminés dans les peptides et les protéines. La liaison peptidique typique dans l’os est l’un des types de liaisons amidiques. Il ne faut donc pas automatiquement inclure les liaisons amidiques utilisant la chaîne latérale d’un acide aminé dans le cadre des liaisons osseuses ordinaires. Les études de la géométrie des peptides se concentrent sur une sous-groupes de liaisons amidiques spécifiques de l’os, et ne considèrent pas toutes les amides possibles comme chimiquement et structuralement identiques. Le nom approprié dépend des groupes impliqués et de leur position dans la molécule. [2]

6. Combien de liaisons peptidiques se trouvent dans un tripeptide ?

Un typique peptide ouvert et non segmenté contient Deux liaisons peptidiques, car trois restes nécessitent deux liaisons pour former un seul chaînon ouvert continu. Cela découle de la relation générale n − 1 pour un chaînon ouvert typique contenant n restes. C’est un calcul résultant de la construction de la molécule et non pas un résultat expérimental ou une information sur sa fonction biologique. La réponse sera différente si le liaison supplémentaire à l’échelle moléculaire enferme la molécule dans un anneau. Les liaisons latérales et les autres liaisons covalentes doivent toutefois être comptées séparément. Avant d’appliquer la règle générale, il convient donc de définir l’architecture de la molécule analysée.

7. Les peptides cycliques possèdent-ils une liaison peptidique supplémentaire ?

Le peptide cyclique de type head-to-tail présente un nombre d’atomes de squelette supplémentaire par rapport au lien ouvert correspondant, car le lien amidique supplémentaire relie les deux extrémités et ferme le cycle. Toutefois, d’autres peptides cycliques peuvent former un cycle avec la participation des chaînes latérales, de sorte que cette règle ne s’applique pas automatiquement à chaque molécule qualifiée comme cyclique. Les études sur la bactérie B1 ont confirmé un cas particulier de structure cyclique comprenant en outre des ponts disacériques. Il convient donc de décrire séparément le fermeture du cycle en un seul cycle et la formation de liaisons entre les chaînes latérales lors du calcul des liaisons et lors de la présentation de l’architecture moléculaire. [6]

8. Les liaisons peptidiques sont-elles toujours parfaitement plates ?

Non. Les groupes peptidiques sont en principe planaires, mais des déformations mesurables de la géométrie idéale sont possibles. Une étude combinant des calculs quantiques-mécaniques avec une analyse des données structurelles des peptides et des protéines a révélé de légères distorsions liées à la configuration locale du squelette. Ces observations complètent un modèle de référence simplifié, mais elles ne le rendent pas inutile. La planarité reste une préférence structurelle importante résultant de la structure électronique du groupe amidique, mais une analyse structurelle précise devrait prendre en compte les différences locales propres à la molécule en question. [2]

9. Peut-on faire courber la protéine si le mouvement autour de la liaison peptidique est limité ?

Oui. Le squelette protéique comprend d'autres liaisons autour desquelles des changements d'angles torsés peuvent se produire. Le mouvement limité autour de la liaison amidique C–N ne maintient donc pas l'ensemble de la chaîne immobile. Les analyses structurelles distinguent les angles de rotation autour des liaisons squelettiques voisines du angle associé au lien peptidique lui-même. Les contraintes stéréochimiques, les interactions chimiques locales et le type des réserves voisines influencent également sur les conformations qui sont énergétiquement et physiquement accessibles. Les protéines ne sont donc ni des barres rigides ni des chaînes constituées de composants qui tournent librement complètement. Leur structure résulte de la combinaison de degrés de liberté limités et relativement élastiques du squelette. [2]

10. Qu’est-ce que les liaisons peptidiques cis et trans ?

Les termes cis et trans décrivent des arrangements spatiaux différents des groupes situés de part et d'autre de la liaison peptidique. Dans les structures protéiques typiques, la configuration trans prédomine. Les liaisons peptidiques liées à la proline nécessitent une attention particulière, car la configuration cis est plus fréquente dans ce cas que dans de nombreuses autres combinaisons de résidus. Dans les études NMR du collagène thermodissocié, on a détecté les deux configurations. Ces résultats concernent cependant un certain type de protéine dans des conditions expérimentales spécifiques et ne doivent pas être interprétés comme des valeurs relatives universelles pour tous les peptides et protéines. Les termes cis et trans décrivent l'architecture de la liaison peptidique et non les différents types de liaisons chimiques. [9]

11. Lors de la formation d'un lien peptidique, de l'eau est-elle toujours libérée directement ?

Non. L’équation connue représentant la libération d’eau décrit la relation sommeille entre les groupes fonctionnels libres, mais elle ne décrit pas tout le mécanisme réel de formation des liaisons peptidiques. La synthèse ribosomesque utilise des substrats activés associés à l’ARNt, et les études expérimentales indiquent la participation de la chimie du substrat à la catalyse. Le cours de réaction est donc plus complexe que la simple élimination de l’eau par deux acides aminés dissous librement. La distinction entre le bilan réactif sommaire et le mécanisme biologique réel empêche de transformer l’équation éducative utile en une description incorrecte de la synthèse protéique. [3]

12. Le mélange des acides aminés avec l’eau conduit à la formation de protéines ?

Non. La combinaison d’aminoacides libres ne crée pas automatiquement une séquence protéique déterminée. La formation contrôlée des peptides nécessite une chimie adéquate et, dans les cellules, également une machinerie de synthèse ordonnée capable de contrôler la séquence des acides aminés et de former des liaisons. Les expériences concernant la formation non-ribosomale des peptides ont montré que le dysfonctionnement d’un élément catalytique déterminé peut empêcher la formation du produit peptidique étudié. Ces résultats concernent un système biosyntétique particulier, mais illustrent une règle plus générale : la simple présence de molécules constituantes ne suffit pas. La formation d’une séquence définie nécessite une formation contrôlée des liaisons moléculaires. [7]

13. L’interconnexion peptidique est-il la même chose que l’interconnexion hydrogène ?

Non. Le liaison peptidique est une liaison covalente dans le schème moléculaire de la molécule, tandis que la liaison hydrogène est une interaction entre le donateur et l’accepteur d’hydrogène correspondants. Les groupes chimiques présents dans le schème peptidique peuvent participer à la formation de liaisons hydrogène sans créer de liaisons peptidiques supplémentaires. Les études sur le dekapeptyde déformé CLN025 ont analysé les liaisons hydrogène et d’autres interactions impliquées dans la stabilisation de sa structure. Cette distinction distingue les liaisons définissant la séquence covalente fondamentale du lien qui contribue à l’organisation du lien dans l’espace tridimensionnel déjà formé. [8]

14. Le pont disiarchimique est-il un type de liaison peptidique ?

Non. Le pont disiarchimique est une liaison covalente carbone-carbone, généralement formée entre les chaînes latérales de la cystine. La liaison peptidique est en revanche une liaison amidique reliant les groupes issus des acides aminés du schéma peptidique. Les études de synthèse de BPTI ont traité la construction du squelette et la formation de ponts disiarchimiques comme des processus distincts. Ces deux types de liaisons peuvent avoir une importance significative pour la structure de la molécule, mais ils relient d'autres atomes et participent à d'autres réactions chimiques. Le démantèlement d'un pont disiarchimique n'a donc pas besoin de couper le schématisme peptidique, tandis que la dissociation de la liaison peptidique modifie directement la continuité de la séquence de la chaîne. [5]

15. La dénaturation des protéines provoque-t-elle la rupture des liaisons peptidiques ?

Cela n’est pas nécessaire. La dénaturalisation signifie une perturbation de la structure typique des protéines en couches ou en groupes, et par définition n’implique pas une déstructuration des liaisons peptidiques. Selon les conditions appliquées, la dégradation chimique peut se produire simultanément avec la dénaturalisation, mais les deux processus ne doivent pas être automatiquement confondus. Dans les études sur le collagène thermodéveloppé, différentes configurations de ses liaisons peptidiques ont été encore analysées. Le premier concerne principalement l’organisation tridimensionnelle, tandis que le second concerne les modifications des liaisons covalentes. [9]

16. L’hydrolyse conduit-elle immédiatement à la formation d’aminois libres ?

Pas toujours. L’hydrolyse d’un lien peptidique interne dans une chaîne longue ouverte conduit généralement à la formation de deux fragments peptidiques plus courts. Des réactions de dégradation ultérieures sont nécessaires pour réduire progressivement la longueur de ces fragments et libérer finalement des acides aminés individuels. Dans les études expérimentales, des fragments spécifiques issus de la dégradation des liaisons peptidiques ont été identifiés, notamment lors des études de la dégradation de l’interleukine 11 et du peptide vasoactif intestinal. Le type de produits dépend des sites dégradés et de l’état avancé de la dégradation. La mention „ hydrolysée ” ne signifie donc pas automatiquement que le peptide ou la protéine a été complètement transformé en acides aminés libres. [11] [12]

17. Les liaisons peptidiques se détachent-elles toutes avec la même rapidité ?

Non. La vitesse d’hydrolyse observée dépend de la séquence du peptide, de la structure moléculaire locale, de la disponibilité des liaisons, des groupes chimiques voisins, de la composition du milieu réactionnel, de la température, du pH et de la présence de catalyseurs tels que les enzymes protéolytiques. Les études sur l’interleukine 11 et le peptide hépatocytaire vasoactif ont montré une dégradation sélective, dépendante des conditions, mais non une conservation uniforme de tous les liaisons. Ces expériences ne permettent pas d’établir un temps de conservation universel pour d’autres peptides. L’hypothèse scientifiquement plausible est que la stabilité des liaisons peptidiques doit être évaluée en fonction de la molécule, de l’environnement et de la réaction en question, et non pas simplement en se basant sur la nomenclature de la liaison. [11] [12]

18. Comment se distingue-t-il du lien peptidique par rapport au lien izopeptidique ?

Le type de liaison peptidique dans l’élastine consiste généralement en une liaison amidique entre la principale partie dérivée de la fonction carboxyle d’une partie de l’élastine et la principale partie aminique de l’autre partie. La liaison izopeptidique est également une liaison amidique, mais dans ce cas, au moins une partie fonctionnelle située en dehors du type de liaison classique de l’élastine intervient dans sa formation. Les deux types de liaisons reposent donc sur une chimie amidique proche, mais occupent des positions différentes dans l’architecture moléculaire. La distinction est importante car la simple détection d’une liaison amidique ne suffit pas à conclure que celle-ci fait partie du type d’élastine classique.

19. Pourquoi les liaisons peptidiques sont-elles importantes pour la structure des protéines ?

Les liaisons peptidiques maintiennent une séquence ordonnée de résidus aminés, tout en imposant des contraintes géométriques au squelette de la molécule. Leur caractère de liaisons covalentes partielles limite le mouvement autour de la liaison amidique C–N et favorise une géométrie approximativement plane de la molécule peptidique. En même temps, les groupes carbonyles et N–H du squelette peuvent participer aux liaisons hydrofuges importantes pour les structures de rang supérieur. Les liaisons peptidiques ne relient donc pas seulement les acides aminés — leurs propriétés électroniques et géométriques aident à déterminer les possibilités structurelles de l’ensemble de la chaîne. [1] [2]

20. Les enzymes peuvent-elles décomposer les liaisons peptidiques ?

Oui. Les protéases et les peptidases peuvent catalyser la hydrolyse des liaisons peptidiques, mais elles n’ont pas forcément pour tâche de couper toutes les liaisons sans distinction. Les enzymes individuelles reconnaissent certaines séquences, des environnements structurels ou des positions dans les chaînes peptidiques. Les études structurales de la pénicillopeptidase ont analysé la façon dont l’aspartate cyclase organise le substrat et l’eau lors de la hydrolyse, tandis que Davidson et Hutton ont montré que cette enzyme sélectionne le traitement des substrats liés au proinsuline. Ces exemples montrent comment les systèmes biologiques peuvent décomposer de manière contrôlée certaines liaisons peptidiques lors du traitement et de la dégradation des molécules. [4] [10]

Les limites de l'interprétation des études sur les liaisons peptidiques

Lors du passage de la chimie de base des liaisons peptidiques aux conclusions concernant les peptides et les protéines réels, il convient de tenir compte de plusieurs limitations.

Premièrement, le groupe peptidique idéalisé présenté dans les manuels est un modèle d'organisation structurelle typique. Les structures moléculaires réelles peuvent présenter des écarts mesurables de la planéité et de la géométrie idéales. [2]

Deuxièmement, la stabilité de la liaison peptidique Cela dépend du contexte.. Les résultats des expériences menées à des températures élevées, avec un pH atypique, un faible taux de concentration ou en présence de certains catalyseurs ne doivent pas automatiquement être utilisés pour prédire le comportement de la molécule dans des conditions totalement différentes. [11] [12]

Troisièmement, différents enzymes utilisent des mécanismes catalytiques différents. Les preuves décrivant l’hydrolyse réalisée par une protéinase aspartique ne signifient pas que toutes les protéines décomposent les liaisons peptidiques de la même manière. [4]

Quatrièmement, les liaisons peptidiques peuvent se produire par différents mécanismes. La traduction ribosomalienne, la biosynthèse non-ribosomale et la synthèse chimique en laboratoire peuvent conduire à la formation d’amides, bien qu’elles utilisent des substrats et des machineries moléculaires différents. [3] [7]

Cinquièmement, le changement de la structure des protéines ne doit pas être automatiquement interprété comme une déstructuration des liaisons peptidiques. La dénaturation, les modifications conformatoires, les liaisons cis-trans, les perturbations des liaisons hydrodynamiques, la réduction des ponts disacryliques et l’hydrolyse des liaisons peptidiques décrivent différents événements moléculaires.

Ces distinctions sont importantes car le terme la liaison peptidique Il décrit un type particulier de liaison covalente. Pour comprendre ce qui se passe réellement avec un peptide ou une protéine, il faut déterminer quels liaisons chimiques ou interactions moléculaires ont été modifiées.

Résumé

Les liaisons peptidiques sont des liaisons amidiques covalentes qui relient les réserves aminiques en chaînes peptidiques et protéiques. Bien que souvent elles soient présentées simplement comme des liaisons C–N dans un fragment de structure répétitif –C(=O)–NH–, La chimie qui les unit est plus complexe que celle des liaisons simples librement rotatives.

La délocalisation des électrons au sein de la groupement amidique confère au lien C–N une partie de caractère covalente double, limitant sa rotation et favorisant une géométrie approximativement plane du groupe peptidique. En même temps, la possibilité de rotation autour des liaisons structurelles voisines permet aux chaînes peptidiques de prendre des structures tridimensionnelles très variées [1] [2].

Les liaisons peptidiques se rencontrent dans le cristal des peptides et des protéines typiques, mais elles doivent être distinguées des liaisons hydrodynamiques, des ponts disacryliques, des interactions joniques, de l’effet hydrophobe et des liaisons spécialisées des chaînes latérales, telles que les liaisons izopeptidiques.

Elles peuvent se former à la suite de différents processus. Les ribosomes forment des liaisons peptidiques lors de la traduction grâce à des substrats activés associés à l’arabinose triphosphate (AT), les systèmes nonribosomaliques utilisent une machinerie enzymatique spécialisée, tandis que la synthèse en laboratoire repose sur des réactions chimiques de liaison contrôlées. [3] [7]

Il est tout aussi important de les décomposer. L’hydrolyse peut diviser le peptide en fragments plus courts, et les proteases et les peptydases permettent aux organismes de réaliser de manière sélective ce processus. Les études sur les proteases, le traitement de la proinsuline, la dégradation de l’interleukine 11 et du peptide vasculaire intestinal, montrent que la décomposition dépend du contexte moléculaire et des conditions expérimentales [4] [10] [11] [12].

La règle la plus importante est donc simple :

Les liaisons peptidiques assurent une continuité covalente des chaînes d'acides aminés, tandis que leur structure électronique, leur formation contrôlée et leur dégradation sélective relient la chimie fondamentale à la biologie des peptides et des protéines.

Avis de non-responsabilité

Cet article a uniquement un caractère éducatif et scientifique. Il explique la chimie des liaisons peptidiques, leur structure moléculaire, la formation, l’hydrolyse et des exemples issus d’études publiées. Il ne constitue pas de conseil médical, d’indications concernant le traitement, d’instructions de laboratoire, de recommandations de produit ou de conseils concernant l’utilisation de tout peptide ou protéine. Les résultats des études calculatoires, structurelles, biochimiques, des études sur les animaux et d’autres expériences doivent être interprétés dans les limites des conditions et des limites propres à chaque étude.

Références

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2. Improta, R., Vitagliano, L., & Esposito, L. (2011). Distorsion des liaisons peptidiques dues à la planarité : nouvelles perspectives issues des calculs mécaniques quantiques et des structures cristallines peptidiques/protéines. PLOS ONE, 6(9), Article e24533. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0024533
3. Weinger, J. S., Parnell, K. M., Dorner, S., Green, R., & Strobel, S. A. (2004). Catabolisme assisté par le substrat de la formation des liaisons peptidiques par le ribosome. Nature Structural & Molecular Biology, 11(11), 1101–1106. https://doi.org/10.1038/nsmb841
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5. Ferrer, M., Woodward, C., & Barany, G. (1992). Synthèse en phase solide de l'inhibiteur de la trypsine pancréatique bovine (BPTI) et de deux analogues. Une approche chimique pour évaluer le rôle des ponts disulfure dans le pliage et la stabilité des protéines. International Journal of Peptide and Protein Research, 40(3–4), 194–207. Récépteur PubMed
6. Saether, O., Craik, D. J., Campbell, I. D., Sletten, K., Juul, J., & Norman, D. G. (1995). Délimination de la structure primaire et tridimensionnelle du polypeptide utérotonique kalata B1. Biochimie, 34(13), 4147–4158. https://doi.org/10.1021/bi00013a002
7. Stachelhaus, T., Mootz, H. D., Bergendahl, V., & Marahiel, M. A. (1998). Formation des liaisons peptidiques dans la biosynthèse des peptides non-ribosomaux. Rôle catalytique du domaine de condensation. Journal of Biological Chemistry, 273(35), 22773–22781. https://doi.org/10.1074/jbc.273.35.22773
8. Hatfield, M. P. D., Murphy, R. F., & Lovas, S. (2010). Propriétés spectroscopiques du VCD du miniprotein CLN025 formant la forme beta-helix dans différents solvants. Biopolymères, 93(5), 442–450. https://doi.org/10.1002/bip.21356
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