Gå til indhold
Pædagogiske materialer

Peptider versus proteiner versus aminosyrer: De vigtigste forskelle

Aminosyrer er de fundamentale molekylære enheder, som peptider og proteiner opbygges af. Peptider er kæder af aminosyrerester forbundet primært med peptidbindinger, hvorimod proteiner består af en eller flere polypeptidkæder, hvis sekvens, struktur, indbyrdes vekselvirkninger, biologiske bearbejdning og funktionelle kontekst påvirker deres identitet. Alle disse grupper er kemisk forbundet med hinanden, men disse begreber kan ikke bruges i flæng.

Forskellen mellem en fri aminosyre og et peptid er relativt nem at bestemme: bindingen af aminosyrer ved hjælp af peptidbindinger fører til dannelsen af et nyt molekyle med en specifik sekvens og måde at binde atomer på. Grænsen mellem mellem et peptid og et protein er betydeligt mindre entydig.

Kædelængden er et nyttigt vejledende kriterium. I undervisningsmaterialer eller visse klassifikationssystemer kan man for eksempel støde på en konventionel grænse på omkring 50 aminosyrerester. Den videnskabelige litteratur anvender dog ikke én universel grænse. En kæde bestående af ti rester er blevet beskrevet som miniprotein, en strukturelt ordnet molekule bestående af 29 restgrupper blev identificeret som polypeptid, og nogle proteiner kan forekomme i en i høj grad uorden tilstand i stedet for at indtage én stabil, kompakt struktur. [1] [2] [3]

Disse eksempler viser en vigtig princip: sekvensens længde giver vigtig information, men er i sig selv ikke tilstrækkelig til entydigt at klassificere enhver aminosyrekæde.

For bedre at kunne skelne peptider, polypeptider og proteiner, er det værd at tage højde for flere egenskaber samtidigt:

  • antallet af aminosyrerester;
  • ichsekvens;
  • om molekylet er lineært, cyklisk, grenet eller flerdelt;
  • kovalent bindingsmåde;
  • eksperimentelt bekræftet struktur;
  • posttranslationelle eller kemiske modifikationer;
  • biologisk procesmetode for et molekyle;
  • den terminologi, der er accepteret for et bestemt molekyle i den videnskabelige litteratur.

I denne artikel forklarer vi, hvordan aminosyrer, peptider, polypeptider og proteiner er relateret til hinanden, hvordan kædelængden påvirker den anvendte terminologi, hvordan peptidbindinger danner kæder, og hvorfor kendskabet sekvens, molekylær arkitektur og eksperimentelt bekræftede egenskaber er mere informativ end selve kategorinavnet.

Hvad er forskellen på aminosyrer, peptider og proteiner?

Aminosyrer er de enkelte byggestenekorrekt

Typisk alfa-aminosyre indeholder et centralt carbonatom forbundet med en aminogruppe, en carboxylsyregruppe, et hydrogenatom og en variabel sidekæde.

Det er netop sidekæden, der adskiller den ene aminosyre fra den anden.

Under de forhold, der findes i mange biologiske miljøer, forekommer amin- og carboxylgrupper ofte i ladede former. Den populære, neutrale strukturformel, der anvendes i grundlæggende kemi, er derfor en nyttig måde at repræsentere en aminosyre på, men den afspejler ikke nødvendigvis dens dominerende iontilstand under alle biologiske forhold.

Sidekæderne hos de enkelte aminosyrer adskiller sig blandt andet ved:

  • med hensyn til størrelse;
  • elektrisk ladning;
  • polarisering;
  • hydrofobicitet;
  • med evne til at danne hydrogenbindinger;
  • rumlige egenskaber;
  • kemisk reaktivitet.

For eksempel har glycin et enkelt hydrogenatom som sidekæde, hvilket gør den strukturelt mindre end de andre standardaminosyrer. Cystein indeholder derimod en sidekæde med et svovlatom, som kan deltage i dannelsen af disulfidbindinger.

Andre aminosyrer kan indeholde aromatiske, sure, basiske, polære eller primært upolære sidekæder.

Disse forskelle hjælper med at forstå, hvorfor udskiftningen af en aminosyre med en anden kan ændre egenskaberne af et peptid eller et protein. Molekylets rygrad kan stadig være forbundet via den samme type peptidbindinger, men de kemiske egenskaber, der skyldes tilstedeværelsen af specifikke sidekæder, ændrer sig.

En aminosyre kan også forekomme og deltage i stofskiftet uafhængigt af peptidet eller proteinet.

Frie aminosyrer er separate molekyler.

Efter indbygger i en peptid- eller proteinkæde betegnes de enkelte enheder mere præcist som aminosyrerester.

I daglig sprogbrug er det forståeligt at sige, at et protein er en „aminosyrekæde”. Fra strukturkemisk synspunkt er betegnelsen „kæde af aminosyrerester” dog mere præcis, fordi inkorporeringen af en aminosyre i kæden ændrer dens kemiske kontekst.

Peptider indeholder aminosyrer forbundet med peptidbindinger

I et typisk peptid skelet er carbonatomet i carbonylgruppen hidrørende fra carboxylgruppen af den ene rest forbundet med nitrogenatomet bundet til den næste rest.

Dette kovalente amidbinding kaldes peptidbinding.

Sammenføjningen af to restrester fører til dannelsen af dipeptid.

Tre rester danner tripeptid.

Fire danner tetrapeptid, og yderligere forlængelse af kæden fører til dannelsen af endnu længere peptider og polypeptider baseret på den samme generelle type kemiske skelet.

Den fremkomne molekyle er mere end blot en samling af sine bestanddele.

En blanding, der indeholder separate molekyler af glycin og alanin, adskiller sig kemisk fra dipeptidet glycylalanin.

Den samlede molekyle har:

  • en bestemt sekvens;
  • definerede kovalente bindinger;
  • specifikke endegrupper;
  • egen molekylvægt;
  • mulige konformationer;
  • kemiske egenskaber, der adskiller sig fra egenskaberne for de enkelte aminosyrer.

Omvendt rækkefølge medfører dannelsen af alanyloglicyny.

Glycylalanin og alanylglycin indeholder de samme typer aminosyrer, men har en anden sekvens.

Denne enkle eksempel viser en af de grundlæggende principper for peptikemi:

Aminosyresammensætning er ikke det samme som aminosyresekvens.

Peptidbindinger har også karakteristiske strukturelle egenskaber. Deres elektroniske arrangement begrænser rotationen omkring carbon-nitrogen-bindingen i rygraden, mens tilstødende bindinger står for en væsentlig del af kædens konformationsfleksibilitet.

Eksperimentelle og beregningsmæssige studier viser, at peptidergruppen er tilnærmelsesvis plan, selvom mindre afvigelser fra ideel planhed er mulige. [4]

Proteiner indeholder en eller flere polypeptiderkæder

Protein forstås sædvanligvis som et biologisk makromolekyle opbygget af af en eller flere polypeptidkæder.

Disse kæder kan danne:

  • sorte globulære strukturer;
  • langstrakte strukturer;
  • membranrelaterede strukturer;
  • fleksible regioner;
  • internt uordnede regioner;
  • komplekser bestående af flere kæder;
  • kombinationer af forskellige strukturelle elementer.

Nogle proteiner indeholder også bundne kulhydrater, lipider, metalioner, prostetiske grupper, kovalente modifikationer eller andre tilhørende bestanddele.

At betegne et givet molekyle som et protein formidler derfor normalt mere information end blot konstateringen af tilstedeværelsen af peptidbindinger.

Dette udtryk placerer molekylet i en bredere strukturelle og biologiske kontekst.

Det betyder dog ikke, at ethvert molekyle, der betegnes som et protein, behøver at have:

  • en specificeret minimumslængde;
  • en permanent stiv struktur;
  • kun én polypeptidkæde;
  • enzymaktivitet;
  • én bestemt type biologisk funktion.

Et godt eksempel er proteinet KISS1.

Forskere brugte blandt andet nuklear magnetisk resonans og røntgenstrålespredning ved lille vinkel til at karakterisere KISS1 som et iturevet, ustruktureret protein, der er lidt mere udstrakt end en typisk statistisk polymerkugle. Dens klassificering som et protein afhænger derfor ikke af tilstedeværelsen af en enkelt kompakt og permanent struktur. [3]

Aminosyrer, peptider og proteiner – en sammenligning

Tjekkisk Aminosyrer Peptider Proteiner
Grundlæggende beskrivelse Enkeltstående molekylære enheder Aminosyreresterkæder Biologiske molekyler, der indeholder en eller flere polypeptidkæder
Kræver det peptidbindinger? Nej, hvis de optræder som frie aminosyrer Tak, i en typisk kæde Tak, i et polypeptid-skelet
Typisk længde En enhed Normalt relativt korte kæder Ofte længere kæder, men der findes undtagelser
Sekvens Gælder ikke for en enkelt fri aminosyre Bestemt rækkefølge af restprodukter Den specifikke sekvens af hver kæde
Struktur Lille molekyl med egne kemiske egenskaber Den kan være fleksibel, struktureret, cyklisk eller modificeret Kan indeholde foldede domener, fleksible eller uordnede regioner
Antal kæder En enkelt molekyle Normalt omtalt som én enkelt kæde, selvom der findes hold En eller flere polypeptidkæder
Biologiske roller Byggestene og deltagerne i stofskiftet De kan have signal-, regulerings-, struktur- eller redoxfunktioner De omfatter enzymer, receptorer, transportører, antistoffer, strukturproteiner og signalmolekyler
Det vigtigste forbehold En fri aminosyre er ikke det samme som en rest i en kæde Navnet „peptid” forudsiger ikke en fælles biologisk virkning Hverken fast længde eller stiv foldning er universelle krav

Tabellen viser konventionelle forskelle og fastsætter ikke en enkelt formel grænse, der gælder for alle molekyler.

Eksempler på korte ordnede molekyler og internt uordnede proteiner viser, hvor forenklede definitioner kræver yderligere forklaring. [1] [2] [3]

Hvilken polymer dannes af aminosyrer?

Når mange aminosyrerester er forbundet med en gentagen rygrad, der indeholder peptidbindinger, dannes der polypeptid.

Et protein kan indeholde en enkelt polypeptidkæde eller flere kæder forbundet i en større struktur.

Disse begreber fremhæver således lidt forskellige træk:

polypeptid henviser primært til kædens kemiske opbygning;

protein beskriver normalt et komplet biologisk molekyle eller molekylært kompleks.

Denne skelnen er nyttig, når man læser videnskabelige publikationer.

I det ene arbejde kan forfatterne beskrive syntesen af et polypeptid, før de bestemmer dets rumlige struktur eller biologiske aktivitet. I et andet kan de analysere et protein sammensat af flere polypeptidkæder.

I ingen af disse tilfælde betyder det en ændring af aminosyrernes grundlæggende kemi.

I et studie, der sammenlignede bakteriel ekspresjon med fastfase-peptidsyntese, blev der analyseret 20- til 40-aminosyre-rester „polypeptider og miniproteiner”. Den anvendte terminologi viser, at disse betegnelser kan overlappe delvist afhængigt af længde, strukturelle egenskaber og den videnskabelige kontekst. [5]

Kædelængde vs. klassificering

Hvad betyder dipeptid, tripeptid, oligopeptid og polypeptid?

Dipeptid indeholder to aminosyrerester.

Tripeptid indeholder tre.

Tilsvarende indeholder henholdsvis tetra- og pentapeptidet fire og fem restgrupper.

Disse navne gør det muligt nøjagtigt at bestemme antallet af restgrupper, hvis de refererer til hele den analyserede kæde.

Oligopeptid betyder normalt en forholdsvis kort kæde.

Polypeptid fremhæver tilstedeværelsen af mange aminosyrerester i en enkelt kæde og bruges ofte, dog ikke altid, med reference til længere sekvenser.

De numeriske grænser mellem betegnelser som oligopeptid, peptid og polypeptid varierer afhængigt af disciplin og publikation.

Derfor er den faktiske sekvens eller det antal restgrupper, som forfatterne har angivet, mere pålideligt end at antage, at alle forskere anvender den samme konvention.

I en typisk uforgrenet, lineær kæde indeholdende n rest forekommer:

n − 1 peptidbindinger i rygraden.

Et tripeptid indeholder således tre restgrupper, men to peptidbindinger.

En åben kæde bestående af ti resterne har ni sådanne bindinger.

Denne relation gælder for en enkelt åben kæde.

Et cyklisk peptid, der er lukket ved en forbindelse mellem N- og C-enden, har en ekstra binding, der lukker backbone-strukturen, og indeholder derfor n peptidbindinger i backbone-strukturen for n restgrupper.

Forbindelserne, der forekommer mellem sidekæderne, skal analyseres separat.

Er 50 aminosyrer grænsen mellem et peptid og et protein?

Længde ca. 50 aminosyrerester bruges ofte som en praktisk pædagogisk konvention til at skelne mellem peptider og proteiner.

Dette er imidlertid ikke en universal kemisk lov.

Overgangen fra 50 til 51 resteksemplarer forårsager ikke nogen pludselig kemisk omdannelse, som automatisk ændrer peptidet til et protein.

De enkelte videnskabsdiscipliner anvender disse begreber på en lidt anden måde, og nogle molekyler bevarer historisk accepterede navne, som ikke svarer til den enkle numeriske grænse.

Et godt eksempel er CLN025.

CLN025 indeholder kun ti rester, og alligevel har forskere beskrevet det som miniprotein og analyserede dens beta-hairpin-struktur ved hjælp af spektroskopi og molekylær dynamik. Den korte længde forhindrede den ikke i at indtage en ordnet konformation under de undersøgte betingelser. [1]

Dette betyder ikke, at ethvert peptid sammensat af ti rester bør kaldes et protein.

Den viser imidlertid, hvorfor alt for kategoriske udsagn som:

„Ethvert protein indeholder mere end 50 aminosyrer”

eller

„Enhver kæde kortere end 50 aminosyrer er et uordentligt peptid”

er for store forenklinger.

En mere præcis tilgang er at behandle antallet af restgrupper som en af flere egenskaber, der beskriver molekylet.

Et kort peptid kan også betegnes som et polypeptid

Et andet godt eksempel er kalat B1.

I den oprindelige strukturundersøgelse blev dette 29-residue plantemolekyle beskrevet som polypeptid, dens cykliske skelet blev bekræftet, og dens tredimensionelle struktur blev undersøgt. [2]

Den forener altså:

  • relativt kort sekvens;
  • cyklisk skeletarkitektur;
  • yderligere kovalente begrænsninger;
  • ordnet rumlig struktur.

Terminet polypeptid behøver derfor ikke at betyde et meget stort molekyle.

Afhængigt af konteksten kan det blot understrege, at det analyserede molekyle er en kæde af aminosyrerester.

Derfor er det i forbindelse med fortolkning af videnskabelig litteratur værd at tjekke den faktiske sekvens, antallet af restriktioner, molekylærarkitekturen og de eksperimentelle resultater i stedet for udelukkende at tillægge det anvendte navn yderligere betydning.

Antallet af restgrupper og molekylvægt er to forskellige mål

Antallet af rester bestemmer, hvor mange aminosyreenheder er der i molekylet.

Molekylmassen beskriver derimod massen af hele molekylet på molekylært niveau.

Disse værdier er forbundet, men de er ikke ensartede.

De enkelte aminosyrerester har forskellige masser. To kæder, der indeholder det samme antal rester, kan derfor have forskellige molekylmasser, hvis de er forskellige i rækkefølge.

Kemiske modifikationer kan også påvirke massen.

Tilsætningen af et kulhydrat, et lipid, en fosfatgruppe, en terminal modifikation eller en anden komponent kan øge molekylens masse uden at øge antallet af aminosyrer i dens skelet.

Et protein kan desuden bestå af flere kæder.

Det samlede antal restgrupper i hele proteinet kan derfor afvige fra længden af hver enkelt kæde.

En præcis videnskabelig beskrivelse bør angive, om den angivne værdi vedrører:

  • længden af ​​en enkelt kæde;
  • det samlede antal restgrupper i komplekset;
  • molekylvægten af en enkelt kæde;
  • masserne af hele det molekylære kompleks.

Ingen af disse parametre bestemmer i sig selv molekysets biologiske aktivitet eller kvaliteten af evidensen for den pågældende virkning.

Den faktiske molekylære form, som analysen vedrører, skal tages i betragtning

Forløberen og dennes omdannelsesprodukter bør ikke automatisk betragtes som havende den samme molekylære sekvens.

For eksempel proinsulin bearbejdes via mellemformer til insulin og C-peptid.

En analytisk gennemgang af proinsulinkonversionsprodukter viser, hvorfor det er vigtigt at skelne mellem disse former, når man fortolker måleresultater. [6]

Undersøgelser af enzymet, der findes i de insulinsekreterende granula, påviste desuden en selektiv fjernelse af basiske restgrupper fra proinsulin-afledte substrater uden yderligere nedbrydning af det modne insulin i den anvendte test. [7]

Det var et eksperiment vedrørende biokemisk bearbejdning, og ikke et bevis på, at alle peptider følger det samme klivningsmønster.

Hvis publikationen angiver et peptids længde, masse, koncentração eller aktivitet, kan det betale sig at fastslå, om den undersøgte værdi vedrører:

  • forløber;
  • indirekte former;
  • modne peptid;
  • fragment, der er opstået som følge af spaltning;
  • af en enkeltkædet molekyle i et flerkædet molekyle;
  • komplette molekylære kompleks.

Uden en sådan skelnen kan to videnskabeligt korrekte beskrivelser tilsyneladende modsige hinanden, selvom de i virkeligheden refererer til forskellige former for den samme eller en beslægtet molekyle.

Struktur, foldning og biologisk funktion

Primær struktur: alt starter med sekvensen

Primærstrukturen betegner aminosyresekvensen, og i en mere fuldstændig kemisk beskrivelse også væsentlige kovalente bindinger.

Typen og rækkefølgen af resterne bestemmer, hvilke sidekæder der er tilgængelige, og hvor på skelettet de er placeret.

Sekvensen kan derfor ikke ligestilles med sammensætningen.

To kæder kan indeholde nøjagtigt de samme typer og antal aminosyre og samtidig have dem arrangeret i en anden rækkefølge.

Ændring af rækkefølgen kan blandt andet påvirke:

  • lastfordeling;
  • fordeling af hydrofobe regioner;
  • lokal elasticitet;
  • mulige bindingstyper for hydrogenbindinger;
  • tendensen til at danne bestemte sekundærstrukturer;
  • genkendelse af andre molekyler;
  • biologisk aktivitet.

Hele sekwensen indeholder derfor meget mere information end blot en almindelig liste over aminosyrer, der findes i molekylet.

Sekvensændringer kan også påvirke forholdet mellem molekylbinding og biologisk respons.

I studiet af et plantesignalpeptid systeminy Det er blevet påvist, že forskellige sekvensregioner deltog forskelligt i receptorbinding og -aktivering. Det fulde molekyle og dets kortere fragmenter var ikke funktionelt ækvivalente. [8]

Sekundær-, tertiær- og kvartærstruktur

Sekundærstruktur beskriver gentagne lokale arrangementer af skelettet, såsom alfa-helixer og beta-foldeblade.

Deres dannelse fremmes blandt andet af ordnede hydrogenbindingssystemer i skelettet.

De opstår dog ikke ved at erstatte de peptidbindinger, der er ansvarlige for primærstrukturen.

Tertiær struktur beskriver den bredere, tredimensionale organisation af en enkelt polypeptidkæde.

Quartordriftsstruktur Det refererer til den måde, hvorpå flere polypeptidkæder er organiseret i et større molekylært kompleks.

Et protein, der er bygget op af én kæde, behøver derfor ikke at have en tetrarrangstruktur.

På samme måde behøver et kort peptid ikke at have alle niveauer af strukturel organisation for at have bestemte biologiske egenskaber.

Organisationen af den molekylære struktur kan blandt andet bidrage med:

  • hydrogenbindinger;
  • elektrostatiske påvirkninger;
  • effekterne af van der Waals;
  • Hydrofobisk effekt;
  • aromatiske virkninger;
  • koordinering af metalioner i nogle molekyler;
  • kovalent bindinger i tværgående retning, såsom disiarck-broer.

Disaccharidiske stoffer, hvis de forekommer, forbinder svovlatommer fra cysteinresterne.

De er kemisk forskellige fra peptidsammenføjninger, der danner kædenes struktur.

Syntetiske undersøgelser livmoderhalsen-trakte inhibitor af trypsin (BPTI) De illustrerer godt forskellen mellem at konstruere en kæde og at opnå dens korrekt formet og aktive form.

Kemiske forskere syntetiserede en lineær sekvens og derefter gennemførte en oxidering og foldning proces, hvilket gav et materiale svarende til det naturlige protein i de beskrevne strukturelle og funktionelle analyser. [9]

Kan peptider have en stabil tredimensionel struktur?

Selv tak.

En kort kæde behøver ikke automatisk at betyde en molekyle uden en organiseret struktur.

CLN025 skabte en beta-hairpin-struktur i de undersøgte miljøer, mens den cykliske kalat B1 viste en ordnet struktur på trods af kun 29 rester.[1][2]

Det drejer sig dog om observationer vedrørende specifikke molekyler.

Det betyder ikke, at ethvert kort peptid skaber en lige så stabil struktur.

Om en bestemt peptid opnår en ordnet konformitet afhænger blandt andet af:

  • sekvenser;
  • interaktioner mellem resterne;
  • begrænsninger som følge af cykliskhed;
  • moster-disiarczkowe;
  • opløsningsmidlets;
  • temperaturer;
  • koncentrationer;
  • tilstedeværelse af bindende partnere;
  • kemiske modifikationer.

Miljøet kan være særligt vigtigt.

I den syntetiske undersøgelse neuropeptidet Y, der indeholder 36 reststoffer, blev konformationen analyseret i en opløsningsmiddelblanding, der hovedsageligt indeholdt trifluoroethanol. En helisk region blev observeret nær C-enden, mens den N-ende del ikke viste en sammenlignelig regelmæssig struktur. [10]

Observationer foretaget i et sådant miljø bør ikke bruges som bevis for, at peptidet har den samme struktur under alle biologiske forhold.

Derfor skal man under fortolkningen af strukturelle undersøgelser være opmærksom på eksperimentelle betingelser.

Udsagn:

„Peptidet skabte en helis i de undersøgte betingelser”

Det er videnskabeligt mere præcist end:

„Peptidet har altid en helisk struktur.”.

Har alle proteiner den samme struktur?

Nej.

Mange proteiner indeholder stabile foldede domæner, men andre har omfattende regioner, der er uorganiseret internt, og nogle kan være i høj grad uorganiserede.

Sådanne molekyler forekommer som dynamiske fællesskaber af forskellige konformationer i stedet for at forbli i én fast tredimensionel struktur hele tiden.

KISS1-undersøgelserne er et direkte eksempel på en sådan situation.

Resultaterne opnået ved hjælp af flere eksperimentelle metoder bekræftede hans indre uordnede karakter. [3]

Dette viser begrænsningerne i den forenklede læremodel, hvor hvert protein fremstilles som en kompakt og ubevægelig partikel.

Det betyder dog ikke, at intern uordnede proteiner ikke kan udvise organisering, egenart af virkninger eller biologisk betydning.

Den interne uorden skal også adskilles fra denaturering.

Det kan udgøre den naturlige egenskab af en given sekvens under bestemte betingelser.

Denaturering betyder imidlertid en forstyrrelse af den eksisterende strukturelle organisation af en molekyle.

Ingen af disse fænomener i sig selv betyder automatisk hydrolyse af peptidsammenhænge eller nedbrydning af en molekyle til frie aminosyrer.

Funktionen afhænger af det specifikke molekyle

Aminosyrer, peptider og proteiner deltager i mange sammenfaldende biologiske processer, men at høre til en af disse kategorier betyder ikke, at de virker sammen.

Signalpeptidet, intracellulært tripeptid, enzymet og det strukturelle protein kan være bygget op af aminosyrerester, men samtidig have helt forskellige funktioner.

For eksempel blev der i et fysiologisk forsøg med deltagelse af mennesker analyseret GLP-1(7–36) Som inkretin blev responsen målt under infusionen hos syv frivillige [11].

Studiet vedrørte et bestemt signalmolekyl og en specifik eksperimentel protokol.

Det giver ikke mulighed for at konkludere, at andre peptider har de samme effekter på insulinsekretionen.

Et andet eksempel er glutathion.

Det er et tripeptid, der deltager i biologiske redoxprocesser i celler. I et af undersøgelserne blev vand med markeret isotop anvendt til at estimere glutationsyntesen hos rotter, hvilket viste, at selv et meget lille peptid kan undersøges som en metabolisk reguleret molekyle. [12]

Det var et studie om biosyntese, ikke et studie om kosttilskud til mennesker.

Fra et videnskabeligt synspunkt er det rette spørgsmål således:

Hvad gør denne specifikke molekyle eller sekvens under hvilke betingelser og på grundlag af hvilke beviser?

Begreberne „peptid” og „protein” hjælper med at beskrive molekylær identitet.

De definerer ikke en universel biologisk funktion.

At opdele kæden kan ændre dens identitet og aktivitet

Hydrolysen fører til opløsning af peptidsammenhænge.

En enkelt spaltning kan føre til dannelse af kortere peptidkæder, mens en mere omfattende hydrolyse kan i sidste ende frigive individuelle aminosyrer.

Et enkelt snit i en lang kæde vil normalt ikke medføre en umiddelbar frigivelse af alle rester af kæden.

Biologisk behandling af molekyler kan anvende selektiv opløsning, blandt andet til:

  • aktivering af prekursorer;
  • afbrydelse af signalsekvenserne;
  • afskillelse af funktionelle regioner;
  • opbygning af modne peptider;
  • afslutning af aktiviteten;
  • opstår af molekyler med forskellige biologiske funktioner.

Studiet af systemin viser, hvorfor man ikke må antage, at et fragment automatisk bevarer aktiviteten af det oprindelige molekyle.

Den endelige N-region deltog i receptormekanismen, mens den C-endelige region var nødvendig for at aktivere den. De undersøgte fragmenter opførte sig ikke bare som kortere versioner af det fulde signalmolekyle. [8]

Fordøjelsen er en anden proces, hvor molekylær identitet ændres.

I et forsøg med mennesker blev der i blodet fundet bestemte peptider fra kollagen efter indtagelse af gelatinhydrolyser. [13]

Det bekræfter tilstedeværelsen af konkrete fragmenter under de betingelser, der gælder for denne undersøgelse.

Det betyder dog ikke, at:

  • alle peptider, der stammer fra fødevarer, optages i uændret form;
  • Hvert peptidsegment gennemgår fordøjelsesprocessen;
  • alle proteolytiske hydrolyseringer opfører sig ens;
  • Selv det at peptidsplittelementet kan opdages bekræfter den pågældende sundhedsmæssige fordel.

Hvorfor er grænsen mellem peptidet og proteinet ikke entydig?

Forskellige frister svarer på forskellige spørgsmål

Begreberne peptyd, polypeptid og protein overlapper delvist, da de ofte understreger andre egenskaber ved molekylet.

Peptid Det tyder oftest på en forholdsvis kort kæde.

Polypeptid understreger det kemiske karakter af aminosyreketonet.

Protein Det refererer normalt til en bestemt biologisk molekyle, et molekylært kompleks eller en enhed med en fastlagt strukturel og funktionel sammenhæng.

Da disse begreber svarer på lidt andre beskrivende spørgsmål, kan deres betydninger delvist overlappe.

Det betyder dog ikke, at alle forskelle forsvinder.

Den frie aminosyre forbliver kemisk set en anden molekyle end den sammenbundne kæde.

Et dipeptid, der består af to rester, er betydeligt mindre og strukturelt mere enkelt end et stort proteinkompleks, der består af mange kæder.

Usikkerhed opstår primært, når man forsøger at etablere sig. en universel tærskel som adskiller alle peptider fra alle proteiner.

Videnskabelige eksempler på begrænsninger ved enkle regler

Et eksempel Observation Hvad viser det? Hvad beviser det ikke?
CLN025 En tiendedelstrøg undersøgt som en beta-hairpin-minibinding Meget korte kæder kan danne ordnede strukturer At hver 10-aminosyre lang peptid er et protein
Kalata B1 En cyklisk 29-rest-kæde, der betegnes som et polypeptid En kort kæde kan have en kompleks og begrænset arkitektur At enhver kort kæde er cyklisk eller på lignende måde stabil
KISS1 Protein karakteriseret som internt uordentligt Protein behøver ikke at have én fast struktur. At uorden betyder skade eller mangel på biologisk værdi
Syntetisk BPTI Kemisk syntetiseret materiale, efter passende foldning, svarede til det naturlige protein i de undersøgte test. Protein kan fremstilles ved kemisk syntese At enhver syntetisk sekvens automatisk bliver deformeret og virker
Proinsulins behandling En forløber fører til oprettelsen af forskellige molekylære produkter Behandlingen ændrer den molekylære form, som vi taler om At prækursor og dets produkter er det samme

Disse eksempler stammer fra strukturelle, syntetiske og biokemiske undersøgelser, og ikke fra publikationer, der fastslår en officiel klassificeringsgrænse.

Deres betydning består primært i at vise begrænsningerne ved for forenklede definitioner. [1] [2] [3] [7] [9]

Naturlig eller syntetisk oprindelse afgør ikke klassificeringen

Et peptid defineres ikke af, at det er fremstillet i et laboratorium.

På samme måde er protein ikke defineret af det faktum, at det er isoleret fra et levende organisme.

Cellerne syntetiserer naturligt peptider og proteiner, mens forskere kan opnå mange aminosyrekedler ved at:

  • kemisk syntese;
  • rekonstitueret ekspression;
  • kemisk syntese uden celler;
  • Andre kontrollerede produktionssystemer.

En undersøgelse, der sammenlignede bakteriell ekspression med syntese i fast fase for sekvenser med 20–40 reststoffer, viste, at valget af produktionsmetode afhænger blandt andet af den specifikke sekvens og forskningskravene. [5]

En molekyle bevæger sig ikke til en anden kemisk kategori kun fordi fremstillingsmetoden er ændret.

På lignende måde viser undersøgelser af syntetisk BPTI, at kemisk syntese kan føre til opnåelse af en molekyle, der klassificeres som et protein. [9]

Alene betegnelsen syntetisk Det bekræfter ikke fuldstændig molekylær lighed, men syntetisk oprindelse udelukker heller ikke klassificeringen som et protein.

Hvordan beskrives en molekyle præcist?

En brugbar videnskabelig beskrivelse bør angive navnet på molekylet og i relevante tilfælde også:

  • aminosyresekvensen;
  • antallet af rester;
  • massepartikelmængde;
  • oplysning om, hvorvidt strukturen er lineær eller cyklisk;
  • antalet kæder;
  • Vigtige kovalente sidebindinger;
  • kemiske modifikationer eller efterfølgende ændringer;
  • strukturelle egenskaber bekræftet eksperimentelt;
  • en bekræftet biologisk funktion.

For eksempel:

„decennium-rest peptid undersøgt som en minibinding med en beta-hairpin-struktur”

Det giver langt flere oplysninger end striden om, hvorvidt en molekyle udelukkende skal høre under kategorien peptider eller proteiner.

Lignende udtryk:

„internally disordered protein”

Det er en videnskabeligt korrekt beskrivelse, og ikke en modsigelse.[1][3]

Denne sondring er særlig vigtig ved fortolkningen af påstande om biologisk virkning.

Bevismaterialet vedrørende et enkelt peptid kan ikke automatisk overføres til et andet blot fordi begge molekyler er korte aminosyrerestkæder.

Klassificeringen fortæller os, hvilken type molekyle vi har at gøre med. For at fastslå, hvad den pågældende molekyle præcist gør, er det imidlertid nødvendigt med undersøgelser af netop denne sekvens og denne molekylform.

Ofte stillede spørgsmål

1. Er alle peptider proteiner?

Nej. Peptider og proteiner har en fælles kemisk basis i form af aminosyrekedler, men ikke alle peptider klassificeres som proteiner. Korte kedler betegnes normalt som peptider, mens begrebet „protein” også tager hensyn til det biologiske, strukturelle og historiske kontekst. CLN025 viser, hvorfor den nøje grænse er svær at fastslå: Forskere beskrev denne tiosekvens som en mini-protein med en ordnet beta-hairpin-struktur. Det betyder dog ikke, at enhver kort kedel er et protein. Det viser blot, at begreberne delvist overlapper, og ingen enkelt restmængde løser alle klassificeringssituationer. [1]

2. Er peptider det samme som aminosyrer?

Nej. Aminosyrer er enkeltstående molekylære enheder, mens peptider indeholder aminosyreresterne forbundet med peptidbindinger. Kombinationen af aminosyrer fører til dannelsen af en molekyle med sin egen sekvens, endestykker, kovalente bindinger og kemiske egenskaber. Det er altså ikke blot en blanding af oprindelige aminosyrer. Systemin-studier viser betydningen af en bestemt sekvens: forskellige dele af det forbundne peptidet deltog forskelligt i bindingen og aktiveringen af receptoren. Resultaterne vedrører et bestemt planteorgan, men de illustrerer godt den generelle princippet, at peptids identitet afhænger af den kombinerede molekylære struktur. [8]

3. Hvilken polymer dannes af aminosyrer?

En kæde dannet ved sammenføjning af aminosyrer ved peptidbinding kaldes en polypeptid. En eller flere polypeptidkæder kan danne et protein, selvom betegnelsen „polypeptid” ikke angiver en specifik rumlig struktur eller biologisk funktion. I litteraturen er dette begreb også blevet brugt om relativt korte sekvenser, der indeholder 20-40 aminosyrer. Den mest præcise generelle definition lyder således „polypeptid”, mens begrebet "protein" anvendes, når det svarer til en bredere biologisk identitet for en given molekyle eller kompleks. [5]

4. Hvordan adskiller aminosyre sig fra andre aminosyrer?

En aminosyre er en enkelt molekyl, der udgør en byggesten, mens resten af aminosyren er den modstykke efter at være blevet indsat i en peptid- eller proteinkæde. Forskellen skyldes denne enheds deltagelse i strukturelle bindinger samt dens bestemte position i sekvensen. I strukturelle undersøgelser af peptider bliver der ofte tale om de enkelte resters positioner, da de påvirker den lokale geometri og molekylære interaktioner. I det daglige sprog bruges betegnelsen „aminosyrer i proteinet” forståeligt nok, men udtrykket „resten af aminosyren” er mere nøjagtigt kemisk set i forhold til den færdige kæde.[4]

5. Er polypeptidet altid et protein?

Nej. En polypeptid beskriver primært en aminosyrekæde og må ikke automatisk betyde, at en molekyle klassificeres som et protein. Denne betegnelse forekommer i undersøgelser af relativt korte molekyler som f.eks. den 29-restede B1-kalat, samt i arbejder om sekvenser med 20–40 resters længde. Brugen af begrebet afhænger af det pågældende fagområde, så ordet „polypeptid” i sig selv definerer ikke en fast længde, en bekræftet form eller en biologisk funktion. Det er bedst at behandle det som en beskrivelse af den kemiske struktur af kæden, og de resterende egenskaber bestemmes ud fra undersøgelser af den konkrete molekyle. [2] [5]

6. Hvor mange aminosyrer skal et protein indeholde?

Der findes ikke et minimum antal restserier, der ville fungere i alle tilfælde. Konventioner baseret på længde er nyttige i undervisningen og klassifikationen, men der findes anerkendte undtagelser. CLN025 indeholder for eksempel ti restserier, men det blev alligevel undersøgt som en ordnet miniballon med en beta-hairpin-struktur. Det betyder ikke, at en praktisk sondring mellem korte peptider og større proteiner er uvæsentlig. Det viser blot, at det er bedst at angive det faktiske antal restserier i stedet for at præsentere én grænse som en universel retningslinje for benævnelse. [1]

7. Er grænsen på 50 aminosyrer en streng videnskabelig regel?

Nej. Grænsen på omkring 50 rester er en praktisk konvention, der anvendes i nogle sammenhænge, men ikke et universelt kemisk lovmæssigt princip. Kemien vedrørende peptidsammenhænge ændrer sig ikke pludselig ved overgangen fra 50 til 51 rester. Undersøgelser, der beskriver korte kæder som miniboller eller polypeptider, viser, at terminologien også kan afhænge af strukturen, det biologiske kontekst og den forskningsmæssige tradition. Forskellige discipliner kan anvende forskellige operationelle definitioner, hvorfor grænsen bør fremstilles som en konvention og ikke som en absolut regel. [1] [5]

8. Kan et kort peptid danne en stabil struktur?

Ja. Nogle korte peptider kan modstå ordnede strukturer under de rette betingelser. CLN025 blev undersøgt som en tioketisk beta-hairpin-struktur, mens den cycliske kalat B1 viste en ordnet struktur på trods af kun 29 rester. Disse resultater viser mulighederne for specifikke sekvenser, ikke alle korte peptider. Foldning afhænger blandt andet af sekvenser, molekylære begrænsninger, opløsningsmiddel, temperatur, koncentration og modifikationer. Strukturel stabilitet bør derfor vurderes i forhold til den specifikke molekyle og det eksperimentelle miljø. [1] [2]

9. Har alle proteiner den samme tredimensionelle form?

Nej. Nogle proteiner eller deres regioner er internt uordnede og forekommer som dynamiske komplekser af forskellige konformationer i stedet for en fast, sammenhængende struktur. Forskning med KISS1 bekræftede netop denne situation. Det betyder ikke, at alle proteiner er uordnede eller at uorden er ensbetydende med skade. Proteinstrukturen spænder fra stabile, formpressede domæner til fleksible regioner og dynamiske konformationskomplekser. Den rigtige beskrivelse afhenter sig af den specifikke molekyle og de eksperimentelle betingelser. [3]

10. Kan to forskellige peptider med samme længde have forskellige virkninger?

Ja. En sådan lighed i restmængden betyder ikke en ensartet sekvens, struktur, kemi eller biologisk aktivitet. Arten af sidekæder og aminosyresekvensen påvirker molekylære interaktioner. Studier af lysin har vist, at forskellige fragmenter af sekvensen deltager forskelligt i bindingen og aktiveringen af receptoren. Dette er ikke en sammenligning af alle mulige peptider med samme længde, men det viser, hvorfor selve restmængden ikke kan forudsige funktioner. Ved at sammenligne to peptider skal man analysere deres sekvens, struktur og direkte eksperimentelle data.[8]

11. Indeholder et tungere molekyle altid flere aminosyrer?

Nej. Molekylets masse afhænger af antallet og typen af aminosyrerester samt af tilstedeværelsen af yderligere kemiske grupper. To peptider med samme antal aminosyrerester kan have forskellig masse, fordi de enkelte aminosyrer har forskellig masse. Kemiske modifikationer kan yderligere øge massen uden at øge antallet af reststoffer i skjelettet. Molekylets masse og antallet af reststoffer beskriver derfor forskellige egenskaber, og ingen af dem alene definerer en universel grænse mellem et peptid og et protein.

12. Skal ethvert protein bestå udelukkende af én kæde?

Nej. Proteiner kan indeholde én eller flere sammenhængende polypeptidkæder. Længden af en enkelt kæde og sammensætningen af et komplet protein er således separate oplysninger. En god illustration af biologisk behandling er insulin: dens modne form indeholder to kæder forbundet med disaccharidmolekyler, der dannes som følge af behandling af proinsulin og fjernelse af peptidet C. Forskning i konverteringsprodukter adskiller disse former i stedet for at behandle prekursor og modnet hormon som identiske molekyler. Ved at angive antallet af reststoffer skal det derfor angives, om det vedrører én kæde, alle kæderne, prekursoret eller den modne form. [6] [7]

13. Opfylder peptider og proteiner de samme funktioner?

De kan deltage i lignende områder inden for biologi, men de enkelte molekyler udfører forskellige funktioner. I GLP-1-studier blev et bestemt peptid analyseret for inkretinaktivitet hos mennesker, mens studier af glutation vedrørte syntesen af tripeptidet, der deltager i redoxprocesser i cellebiologi. Det betyder ikke, at alle peptider udviser nogen af disse funktioner, ligesom alle proteiner ikke har én fælles funktion. Et videnskabeligt begrundet sammenligning bør omfatte specifikke molekyler, deres sekvenser og eksperimentelt bekræftede egenskaber. [11] [12]

14. Opretholder peptidsubstansen sin funktion som stamcelle?

Ikke nødvendigvis. Splittelsen kan fjerne det regionen ansvarlig for bindingen, regionen som er nødvendig for aktivering, og afsløre et nyt fragment eller føre til dannelse af et produkt med en helt anden biologisk funktion. I undersøgelsen af systemin replikerede fragmenterne ikke blot det fulde samspil mellem binding- og aktiveringsegenskaberne for hele molekylet. Resultatet afhænger af den specifikke sekvens og kan ikke automatisk overføres til alle splittede produkter. Fragmentet bør betragtes som en separat molekylær form, der kræver egne data om struktur og aktivitet. [8]

15. Ændrer denaturering proteinet til aminosyrer?

Nej. Denaturering forstyrrer de højere niveauer af strukturel proteinbinding, men defineret set kræver det ikke opløsning af proteinets peptidiske skel. Oprettelsen af kortere peptider eller frie aminosyrer kræver hydrolyse af peptidskæderne, hvilket er en anden kemisk proces. Selve strukturel uorden betyder ikke nødvendigvis nedbrydning, hvilket er tilfældet med det ubeskadigede, internt uordenligt KISS1-protein. Under meget aggressive betingelser kan både denaturering og kemisk nedbrydning forekomme samtidigt, men de er stadig separate processer: tabet af formen er ikke det samme som opløsning af den koblingsfyldte kæde. [3]

16. Kan et syntetisk molekyle stadig være et protein?

Ja. Kemisk syntese udelukker ikke klassificeringen af en molekyle som et protein. Kemiske forskere syntetiserede en svinelever-trypsinhæmmer og efter passende oxygenering og folding opnåede de et materiale svarende til det naturlige protein i de beskrevne analytiske og funktionelle sammenligninger, herunder med hensyn til hæmmende aktivitet. Resultatet afhang af den korrekte opbygning af sekvensen, foldingen og karakteristikaene, og det betyder ikke, at ethvert syntetisk polypeptid automatisk opnår den korrekte struktur. Klassificeringen afhænger af molekylær identitet og kontekst, mens fremstillingsmetoden er en separat egenskab. [9]

17. Er proteiner, proteinhydrolyser og frie aminosyrer det samme?

Nej. Levnedsmiddelkødæmninger er større sammenhængende molekyler, proteinhydrolysat indeholder en blanding af nedbrydningsprodukter, mens frie aminosyrer er enkeltstående molekylære enheder. Deres sammensætning og molekylære former er derfor forskellige. I en undersøgelse med mennesker blev bestemte peptider fra kollagen fundet i blodet efter indtagelse af gelatindihydrolysatser, hvilket viste, at der kan forekomme identificerbare peptidfragmenter i fordøjelses- og absorptionsprocessen. Men undersøgelsen bekræftede ikke, at alle peptider optages universelt i uændret form eller at alle proteindele har samme virkning. [13]

18. Hvad adskiller peptidet fra polypeptidet?

Begge termer beskriver kæder af aminosyrerestersammenføjning via peptidbindinger. Navnet „peptid” bruges ofte om relativt korte kæder, mens navnet „polypeptid” fremhæver en kompleks aminosyrerest og bruges om længere sekvenser. Der findes dog ikke et universelt numerisk punkt, over hvilket én betegnelse skal erstattes med en anden. Forskning, der beskriver en 29-restkæde af B1-kalat som et polypeptid, og arbejde med 20-40-restkæder af polypeptider viser overlapning af disse terminologier. Den faktiske restmængde og molekylarkitekturen er derfor mere informative end en fastgrænse. [2] [5]

19. Kan de samme aminosyrer danne forskellige peptider?

Ja. Dette sæt af aminosyretyper kan føre til dannelse af forskellige peptider, hvis sekvensen ændres. For eksempel indeholder glycyloalanin og alanloglicin glycin og alanin, men omvendt set kan ændring af sekvensen føre til en anden molekylær sekvens. I længere peptider kan ændring af sekvensen påvirke ladningsfordelingen, hydrofobe områder, bindende overflader og strukturelle tendenser. Derfor afhænger peptidets identitet ikke kun af hvilke aminosyrer det indeholder, men også af deres sekvens og sammenkoblingsmåde.

20. Hvorfor er sekvensen vigtigere end blot betegnelsen „peptid”?

Udtrykket „peptid” beskriver en bred kemisk kategori og ikke en enkelt type biologisk aktivitet. To peptider kan have fuldstændig forskellige sekvenser, længder, strukturer, lokaliseringer, behandlingsmåder og molekylære formål. Systeminstudier viser eksperimentelt, at selv forskellige regioner i en enkelt molekyle kan spille forskellige roller i bindingen og aktiveringen af receptoren. [8] Derfor kan resultater vedrørende et enkelt peptid ikke overføres til et andet blot fordi begge molekyler tilhører samme kategori. For at fastslå den biologiske funktion er der brug for data om en specifik sekvens og en specifik molekyle.

Begrænsninger for klassificering af peptider og proteiner

Når man anvender betegnelserne "aminosyre", "peptid", "polypeptid" og "protein", er der nogle begrænsninger at huske på.

For det første:, Der findes ikke nogen universel numerisk grænse mellem et peptid og et protein. En grænse som 50 rester kan være en nyttig konvention, men den videnskabelige litteratur indeholder klare undtagelser.[1][2][5]

For det andet, strukturen skaber heller ikke en simpel grænse. Nogle korte peptider opnår en ordnet struktur, mens nogle anerkendte proteiner i høj grad forbliver internt uordnede.[1][2][3]

For det tredje, Molekylmasse og restmængde er forbundne, men separate parametre. Modifikationer, forskellige typer restmængder og tilstedeværelsen af flere kæder kan ændre massen uden at det har nogen direkte effekt på længden af det enkelte kæde.

Fjerde, Det er nødvendigt at skelne mellem prekursoriske og modne former.. Biologisk behandling kan ændre kædenes længde, forbindelsesmåden og molekylær identitet, hvilket er tilfældet ved behandling af proinsulin [6] [7].

Femte, Produktionsmetoden bestemmer ikke klassificeringen. Partikler, der dannes naturligt og kemisk syntetiseres, kan have samme grundlæggende molekylære identitet, hvis deres sekvens, struktur og andre væsentlige egenskaber er blevet bekræftet. [5] [9]

Sjette, At være optaget i en kategori gør det ikke muligt at forudsige biologisk adfærd. Peptider har ikke ét fælles fysiologisk virkning, blot fordi de er peptider; ligesom alle proteiner har ikke alle peptider én funktion. [8] [11] [12]

Konstruktionsobservatorier skal endelig fortolkes under de betingelser, hvor de blev opnået. Et peptid, der opnår en bestemt konformitet i et bestemt opløsningsmiddel eller eksperimentelt miljø, kan opføre sig anderledes under andre betingelser. [10]

Disse begrænsninger betyder ikke, at terminologien er ubrugelig. De viser blot, hvorfor det er bedst at bruge den sammen med en mere præcis beskrivelse af molekylære egenskaber.

Sammenfatning

Aminosyrer, peptider, polypeptider og proteiner hører til den samme brede kemiske hierarki, men de beskriver forskellige niveauer af molekylær organisation.

Aminosyrer de er enkeltstående byggestenheder.

Når de resterende aminosyrer bliver kobler ved peptidbindinger, dannes der Peptider og polypeptidkæder.

Proteiner De består af en eller flere sådanne kæder, der behandles i en bredere strukturel og biologisk sammenhæng.

Overgangen fra aminosyre til peptid er kemisk tydelig, da dannelsen af en peptidbinding fører til dannelsen af et nyt, forbundet molekyle.

Grænsen mellem peptidet og proteinet er betydeligt mindre entydig.

Længden af kæden giver nyttige beskrivende oplysninger, men der findes ikke en universel grænse for antallet af rester, som korrekt ville klassificere hver enkelt molekyle. Undersøgelser af det ti-restede minibol klebet CLN025, den 29-restede cycliske kalat B1 og det internt uordnede protein KISS1 viser, hvorfor simple regler kræver yderligere kontekst. [1] [2] [3]

Strukturen angiver heller ikke nogen universel grænse. Korte peptider kan have ordnede konformationer, mens nogle proteiner kan indeholde en betydelig grad af uorden.

På samme måde er molekylmasse, naturlig eller syntetisk oprindelse og biologisk funktion ikke i sig selv tilstrækkelige til at bestemme, om enhver aminosyrekæde skal betegnes som et peptid eller et protein.

Derfor er det mest informative i videnskabelig kommunikation at beskrive det præcist. en bestemt molekyle:

Dens sekvens, restmængder, arkitektur, modifikationer, eksperimentelt observeret struktur, forarbejdningstilstand og bekræftede biologiske egenskaber.

Den vigtigste forskel kan opsummeres som følger:

Aminosyrer er byggestenene; peptidbindinger forbinder disse enheder til peptider og polypeptidkæder; proteiner er derimod biologiske molekyler, der er opbygget af én eller flere sådanne kæder. Grænsen mellem peptid og protein skyldes dog den videnskabelige konvention og molekylære kontekst, ikke én universel mængde aminosyrer.

Ansvarsfraskrivelse

Artiklen har udelukkende en uddannelsesmæssig og videnskabelig-informativ karakter. Det forklarer terminologi, molekylær struktur, klassifikation af peptider og proteiner, biologisk behandling af molekyler samt eksempler fra offentliggjorte undersøgelser. Det er ikke en medicinsk, ernæringsmæssig rådgivning, en retningslinje for behandling, en anbefaling af et produkt eller en rådgivning om anvendelse af peptider, proteiner, aminosyreprodukter, kosttilskud eller relaterede stoffer. Resultaterne af strukturelle, biokemiske, dyreforsøg og forsøg med mennesker skal fortolkes i sammenhæng med metoderne, betingelserne og begrænsningerne i de enkelte undersøgelser.

Referencer

  1. Hatfield, M. P. D., Murphy, R. F., & Lovas, S. (2010). VCD-spektroskopiske egenskaber ved beta-hårnede miniprotein CLN025 i forskellige opløsningsmidler. Biopolymerer, 93(5), 442–450. https://doi.org/10.1002/bip.21356
  2. Saether, O., Craik, D. J., Campbell, I. D., Sletten, K., Juul, J., & Norman, D. G. (1995). Afklaring af den primære og tredimensionelle struktur af det uterotiske polypeptid kalata B1. Biokemi, 34(13), 4147–4158. https://doi.org/10.1021/bi00013a002
  3. Ibanez de Opakua, A., Merino, N., Villate, M., Cordeiro, T. N., Ormaza, G., Sanchez-Carbayo, M., Diercks, T., Bernado, P., & Blanco, F. J. (2017). Metastaseksuderen KISS1 er et protein med indre uorden, der er lidt mere udvidet end en tilfældig spiral. PLOS ONE, 12(2), Artikel e0172507. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0172507
  4. Improta, R., Vitagliano, L., & Esposito, L. (2011). Peptidebindingens forvrængninger på grund af planaritetsforhold: Nye indsigter fra kvantemekaniske beregninger og peptid-/protein-krystalstrukturer. PLOS ONE, 6(9), Artikel e24533. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0024533
  5. Straner, P., Taricska, N., Szabo, M., Toth, G. K., & Perczel, A. (2016). Bakteriel ekspression og/eller fastfase-peptidsyntese af polypeptider og miniproteiner med en længde på 20-40 aminosyrer, casestudiet med Class B GPCR-ligander. Current Protein & Peptide Science, 17(2), 147–155. https://doi.org/10.2174/1389203716666151102105215
  6. Linde, S., Welinder, B. S., & Nielsen, J. H. (1993). Analyse af proinsulin og dets omdannelsesprodukter ved højtydende flydende kromatografi i omvendt fase. Journal of Chromatography, 614(2), 185–204. https://doi.org/10.1016/0378-4347(93)80309-r
  7. Davidson, H. W., & Hutton, J. C. (1987). Karboksypeptidase H, der sekreterer insulin: Fremstilling og demonstrering af dets indflydelse på proinsulin-syntesen. Biokemisk Tidsskrift, 245(2), 575–582. https://doi.org/10.1042/bj2450575
  8. Meindl, T., Boller, T., & Felix, G. (1998). Planthormonsystemet binder sig til den N-terminale del af sin receptor, men det kræver den C-terminale del for at blive aktiveret. The Plant Cell, 10(9), 1561–1570. https://doi.org/10.1105/tpc.10.9.1561
  9. Ferrer, M., Woodward, C., & Barany, G. (1992). Fusionssyntese i fast fase af bovin pankreatisk trypsininhibitor (BPTI) og to analoger. En kemisk tilgang til at evaluere disulfidbroernes rolle i proteinfoldning og stabilitet. International Journal of Peptide and Protein Research, 40(3–4), 194–207. PubMed-optegnelse
  10. Mierke, D. F., Durr, H., Kessler, H., & Jung, G. (1992). Neuropeptide Y. Optimeret fastfase-syntese og konformationsanalyse i trifluorethanol. European Journal of Biochemistry, 206(1), 39–48. https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1992.tb16899.x
  11. Kreymann, B., Williams, G., Ghatei, M. A., & Bloom, S. R. (1987). Glucagon-like peptide-1 7-36: En fysiologisk incretin hos mennesker. The Lancet, 2(8571), 1300–1304. https://doi.org/10.1016/s0140-6736(87)91194-9
  12. Cabral, C. B., Bullock, K. H., Bischoff, D. J., Tompkins, R. G., Yu, Y. M., & Kelleher, J. K. (2008). Estimering af glutathionsyntese med deutereret vand: En model for peptidbiosyntese. Analytisk biokemi, 379(1), 40–44. https://doi.org/10.1016/j.ab.2008.04.042
  13. Iwai, K., Hasegawa, T., Taguchi, Y., Morimatsu, F., Sato, K., Nakamura, Y., Higashi, A., Kido, Y., Nakabo, Y., & Ohtsuki, K. (2005). Identifikation af fødevareafledte kollagenpeptider i menneskelig blod efter oral indtagelse af gelatinhydrolysat. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 53(16), 6531–6536. https://doi.org/10.1021/jf050206p
BioEvidenceHub
Oversigt over privatlivets fred

Denne hjemmeside bruger cookies, så vi kan give dig den bedst mulige brugeroplevelse. Cookieoplysninger gemmes i din browser og udfører funktioner som at genkende dig, når du vender tilbage til vores hjemmeside, og hjælpe vores team med at forstå, hvilke dele af hjemmesiden du finder mest interessante og nyttige.